206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2699 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  100 
 
 
304 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  43.9 
 
 
366 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  43.73 
 
 
281 aa  195  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  43.2 
 
 
361 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  41.64 
 
 
370 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4656  Siderophore-interacting protein  45.08 
 
 
261 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  41.04 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  42.03 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  42.51 
 
 
270 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  40.96 
 
 
281 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1773  siderophore-interacting protein  40.48 
 
 
354 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  38.31 
 
 
273 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  42 
 
 
288 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  38.31 
 
 
273 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  38.31 
 
 
273 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  38.31 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  38.7 
 
 
273 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  38.7 
 
 
273 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  39.25 
 
 
270 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.49 
 
 
279 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  39.26 
 
 
285 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  39.26 
 
 
285 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  41.34 
 
 
271 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  38.2 
 
 
275 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  38.2 
 
 
275 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  38.2 
 
 
275 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  38.2 
 
 
275 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  38.2 
 
 
275 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  38.2 
 
 
275 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  38.2 
 
 
275 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  38.46 
 
 
623 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  40.4 
 
 
311 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  38.52 
 
 
617 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  39.31 
 
 
275 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  38.89 
 
 
285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.7 
 
 
283 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6722  Siderophore-interacting protein  36.29 
 
 
349 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550685  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  37.45 
 
 
275 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  39.36 
 
 
265 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  41.04 
 
 
261 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  40.46 
 
 
297 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  39.69 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  38.58 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  41.13 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  39.11 
 
 
255 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.43 
 
 
296 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  40.32 
 
 
280 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  39.27 
 
 
272 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  40 
 
 
289 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  37.55 
 
 
247 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  36.55 
 
 
291 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3395  vibriobactin utilization protein ViuB  35.36 
 
 
295 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.472238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  39.11 
 
 
340 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.34 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  37.45 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  37.25 
 
 
348 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  34.39 
 
 
257 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  37.05 
 
 
255 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  37.26 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  38.43 
 
 
277 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0773  siderophore-interacting protein  39.33 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  36.5 
 
 
251 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  37.86 
 
 
253 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  34.25 
 
 
272 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  36.43 
 
 
252 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  37.86 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  35.36 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  36.63 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  38.04 
 
 
277 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  33.21 
 
 
271 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  37.35 
 
 
267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  35.74 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  37.63 
 
 
284 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.74 
 
 
247 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.24 
 
 
281 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  34.48 
 
 
246 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.3 
 
 
289 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  37.45 
 
 
253 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2266  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.48 
 
 
267 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2573  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.1 
 
 
267 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.09 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.47 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.09 
 
 
250 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  38.55 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  38.1 
 
 
277 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  33.09 
 
 
247 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  34.15 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  33.98 
 
 
275 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  35.69 
 
 
274 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5386  Siderophore-interacting protein  37.07 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0562315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.48 
 
 
272 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.16 
 
 
283 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.34 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3413  siderophore-interacting protein  34.38 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185243  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.29 
 
 
274 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  36.88 
 
 
267 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.16 
 
 
257 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.87 
 
 
308 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3678  siderophore-interacting protein  33.93 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17630  siderophore-interacting protein  32.36 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.868687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>