206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13510 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  100 
 
 
267 aa  540  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  59.02 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  55.39 
 
 
297 aa  271  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  52.94 
 
 
289 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  55.08 
 
 
277 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  55.08 
 
 
277 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  50 
 
 
279 aa  258  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  49.07 
 
 
277 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  54.72 
 
 
283 aa  248  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  51.39 
 
 
274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  50.4 
 
 
267 aa  238  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3561  Siderophore-interacting protein  51.12 
 
 
283 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0773  siderophore-interacting protein  49.06 
 
 
279 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  51.18 
 
 
281 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  50.99 
 
 
280 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  46.72 
 
 
285 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  46.35 
 
 
285 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  46.35 
 
 
285 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  43.84 
 
 
281 aa  215  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  49.81 
 
 
274 aa  214  8e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  47.47 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  44.53 
 
 
296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  43.01 
 
 
281 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12909  mycobactin utilization protein viuB  45.22 
 
 
283 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000043443  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08230  siderophore-interacting protein  44.74 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.227116  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  43.08 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  43.19 
 
 
284 aa  181  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5386  Siderophore-interacting protein  44.22 
 
 
251 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0562315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3647  siderophore-interacting protein  40 
 
 
273 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17630  siderophore-interacting protein  38.19 
 
 
285 aa  176  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.868687  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  40.82 
 
 
258 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0833  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.71 
 
 
267 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  40.66 
 
 
340 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  38.27 
 
 
270 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02400  siderophore-interacting protein  40.59 
 
 
292 aa  151  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  38.17 
 
 
281 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  40.49 
 
 
261 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  38.84 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  39.26 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0237  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.83 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  38.33 
 
 
270 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  37.07 
 
 
279 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  37.55 
 
 
275 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  37.55 
 
 
275 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  37.55 
 
 
275 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  37.55 
 
 
275 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  37.55 
 
 
275 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  37.55 
 
 
275 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  37.55 
 
 
275 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  39.84 
 
 
273 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  37.86 
 
 
291 aa  138  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  40.65 
 
 
273 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  39.84 
 
 
273 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  40.32 
 
 
348 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.45 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  35.06 
 
 
277 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  35.11 
 
 
276 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  39.43 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  34.9 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  39.43 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  35.05 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  38.4 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  37.85 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  39.02 
 
 
273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  36.33 
 
 
275 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.2 
 
 
281 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  37.55 
 
 
275 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.02 
 
 
299 aa  131  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  37.19 
 
 
278 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.1 
 
 
308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.61 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  36.84 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  36.84 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  38.4 
 
 
311 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  36.22 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.14 
 
 
283 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1601  Siderophore-interacting protein  35.02 
 
 
265 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  34.94 
 
 
272 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03816  putative siderophore utilization protein  31.23 
 
 
257 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3213  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.57 
 
 
325 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000110595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  37.25 
 
 
290 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  36.18 
 
 
623 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  34.17 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.69 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  35.43 
 
 
617 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.89 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  31.58 
 
 
257 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  31.1 
 
 
246 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2998  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.02 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0124793  normal  0.0292007 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  30.36 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3789  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.79 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1437  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.21 
 
 
315 aa  115  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  33.88 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  35.91 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3252  hypothetical protein  31.54 
 
 
302 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
366 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  33.73 
 
 
278 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0628  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.19 
 
 
299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  34.9 
 
 
361 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21440  siderophore-interacting protein  33.2 
 
 
277 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  0.530536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>