196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2259 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2259  FAD-binding 9, siderophore-interacting  100 
 
 
254 aa  527  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2392  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  42.25 
 
 
264 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.3 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.68 
 
 
247 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.23 
 
 
281 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  30.68 
 
 
251 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  28.69 
 
 
248 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  28.69 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  28.69 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  30.28 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  30.28 
 
 
252 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  29.48 
 
 
250 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  29.79 
 
 
274 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.13 
 
 
270 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  32.81 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  30.95 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.35 
 
 
273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  28.23 
 
 
257 aa  118  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  27.13 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  30.8 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.28 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  31.75 
 
 
273 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.75 
 
 
273 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  32.78 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03816  putative siderophore utilization protein  29.89 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  32.78 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  27.45 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  28.57 
 
 
272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  31.35 
 
 
275 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  31.35 
 
 
275 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  31.35 
 
 
275 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  31.35 
 
 
275 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  31.35 
 
 
275 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  31.35 
 
 
275 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  31.35 
 
 
275 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.63 
 
 
271 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  30.4 
 
 
275 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.54 
 
 
279 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  31.4 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  30.15 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.91 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  26.19 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.8 
 
 
283 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  25.6 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.74 
 
 
274 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  30.54 
 
 
247 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.6 
 
 
278 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  28.98 
 
 
288 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  29.37 
 
 
267 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  28.97 
 
 
277 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  30.24 
 
 
265 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  28.51 
 
 
277 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  30.74 
 
 
289 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2266  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.56 
 
 
267 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  28.4 
 
 
281 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2573  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  26.77 
 
 
267 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.48 
 
 
281 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  29.62 
 
 
311 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  28.3 
 
 
297 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  29.6 
 
 
270 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.92 
 
 
257 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  28.16 
 
 
279 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  29.72 
 
 
266 aa  99  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0773  siderophore-interacting protein  29.77 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  28.4 
 
 
278 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.65 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.07 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  29 
 
 
274 aa  95.1  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_003296  RS03709  hypothetical protein  29.18 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  30.53 
 
 
258 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0811  FAD-binding 9, siderophore-interacting  28.9 
 
 
225 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.330061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  28.12 
 
 
290 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  33.06 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0997  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  28.24 
 
 
210 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  29.07 
 
 
280 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  30.52 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3953  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.01 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.568339  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4066  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.01 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515055 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3539  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.91 
 
 
268 aa  92  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  26.94 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3395  vibriobactin utilization protein ViuB  27.41 
 
 
295 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.472238 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3561  Siderophore-interacting protein  29.17 
 
 
283 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  23.85 
 
 
284 aa  89.7  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  24.91 
 
 
340 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.67 
 
 
253 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  29.67 
 
 
253 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  26.55 
 
 
273 aa  88.6  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.72 
 
 
253 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1773  siderophore-interacting protein  26.09 
 
 
354 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  29.1 
 
 
348 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  27.52 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  28 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3473  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  24.14 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100108  hitchhiker  0.00465132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  27.76 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3252  hypothetical protein  26 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  26.87 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  26.87 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  26.87 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2173  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.45 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0791652  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2448  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.53 
 
 
256 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>