More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0301 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  57.46 
 
 
539 aa  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  59.7 
 
 
541 aa  690    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  60.85 
 
 
541 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  60.48 
 
 
541 aa  701    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  57.88 
 
 
539 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  57.2 
 
 
546 aa  693    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  58.58 
 
 
541 aa  663    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  58.63 
 
 
539 aa  684    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  58.44 
 
 
539 aa  684    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  60.45 
 
 
541 aa  694    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  55.7 
 
 
569 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  59.44 
 
 
541 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  57.09 
 
 
536 aa  649    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  56.77 
 
 
542 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  61.6 
 
 
541 aa  718    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  57.88 
 
 
539 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  61.34 
 
 
541 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  62.2 
 
 
541 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  60.15 
 
 
534 aa  692    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  57.84 
 
 
539 aa  673    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  55.84 
 
 
542 aa  658    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  59.7 
 
 
541 aa  693    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  57.36 
 
 
540 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  100 
 
 
545 aa  1124    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  58.6 
 
 
540 aa  677    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  55.84 
 
 
542 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  58.4 
 
 
541 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  56.59 
 
 
542 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  63.75 
 
 
540 aa  722    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  56.59 
 
 
542 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  58.25 
 
 
526 aa  629  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  52.6 
 
 
542 aa  614  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  54.94 
 
 
524 aa  610  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  54.55 
 
 
560 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  59.36 
 
 
459 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  43.63 
 
 
588 aa  424  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.82 
 
 
471 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  32.92 
 
 
479 aa  243  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.37 
 
 
477 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  33.2 
 
 
479 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.37 
 
 
479 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.37 
 
 
479 aa  239  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.37 
 
 
479 aa  239  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.37 
 
 
479 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.37 
 
 
479 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.37 
 
 
479 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.37 
 
 
479 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.89 
 
 
479 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.37 
 
 
479 aa  238  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  33.84 
 
 
466 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.98 
 
 
482 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  32.98 
 
 
482 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  34.13 
 
 
457 aa  228  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  33.94 
 
 
476 aa  228  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.49 
 
 
475 aa  223  6e-57  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
477 aa  218  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  33.57 
 
 
472 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.19 
 
 
475 aa  212  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  30 
 
 
482 aa  193  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  27.86 
 
 
478 aa  171  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  26.42 
 
 
496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  28.97 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  27.57 
 
 
468 aa  163  6e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  26.53 
 
 
475 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  28.35 
 
 
479 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.54 
 
 
483 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1244  Aldehyde Dehydrogenase  27.58 
 
 
490 aa  161  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00471898  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0070  aldehyde dehydrogenase A  28.27 
 
 
482 aa  160  5e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1729  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  27.27 
 
 
474 aa  160  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  26.45 
 
 
474 aa  160  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  28.07 
 
 
475 aa  159  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.57 
 
 
469 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  26.83 
 
 
481 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  28.93 
 
 
483 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  28.93 
 
 
483 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  28.93 
 
 
483 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  27.84 
 
 
457 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  29.78 
 
 
461 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  26.28 
 
 
489 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  29.25 
 
 
483 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  29.11 
 
 
483 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1715  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  26.83 
 
 
481 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.78365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1563  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  26.83 
 
 
481 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  29.11 
 
 
483 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2049  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  26.88 
 
 
484 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000445966  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31599  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.77 
 
 
471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  29.14 
 
 
483 aa  157  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1712  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  26.83 
 
 
481 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  28.72 
 
 
483 aa  157  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3373  Aldehyde Dehydrogenase  26.44 
 
 
532 aa  156  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  27.21 
 
 
484 aa  156  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3882  aldehyde dehydrogenase  28.71 
 
 
461 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  28.93 
 
 
483 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2050  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  27.04 
 
 
474 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000200583 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  28.74 
 
 
475 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  27.98 
 
 
522 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0563  betaine aldehyde dehydrogenase  27.69 
 
 
487 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  0.578799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1744  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  26.83 
 
 
481 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.285549  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0353  aldehyde dehydrogenase  27.09 
 
 
484 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000407244  normal  0.855721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  26.86 
 
 
477 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>