More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl259 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
472 aa  952    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  60.21 
 
 
471 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  47.42 
 
 
477 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  47.85 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  47.85 
 
 
479 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  47.42 
 
 
479 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  47.85 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  47.85 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  47.85 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  47.21 
 
 
479 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  47.64 
 
 
479 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  47.42 
 
 
479 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  47.92 
 
 
479 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  47.64 
 
 
479 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  46.1 
 
 
466 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  46.57 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  46.35 
 
 
482 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  44.59 
 
 
475 aa  425  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  46.8 
 
 
457 aa  427  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  46.32 
 
 
476 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  45.99 
 
 
477 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.64 
 
 
475 aa  414  1e-114  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  41.3 
 
 
482 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  35 
 
 
478 aa  268  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.08 
 
 
488 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  32.89 
 
 
464 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  33.62 
 
 
479 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  34.75 
 
 
475 aa  259  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  33.12 
 
 
482 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.91 
 
 
482 aa  259  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  33.12 
 
 
482 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.12 
 
 
482 aa  259  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.12 
 
 
482 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.91 
 
 
482 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
486 aa  257  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.97 
 
 
482 aa  257  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.7 
 
 
482 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.91 
 
 
482 aa  256  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.76 
 
 
479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  34.48 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.76 
 
 
479 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
480 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  32.92 
 
 
470 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  32.16 
 
 
477 aa  252  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.19 
 
 
481 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  32.98 
 
 
480 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
484 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.19 
 
 
487 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.9 
 
 
480 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.26 
 
 
480 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.71 
 
 
483 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.77 
 
 
482 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.77 
 
 
482 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.77 
 
 
482 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  32.14 
 
 
480 aa  250  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.77 
 
 
482 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.55 
 
 
486 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  32.97 
 
 
509 aa  249  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5877  aldehyde dehydrogenase  31.66 
 
 
480 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.7 
 
 
484 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  31.59 
 
 
494 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.19 
 
 
490 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.21 
 
 
500 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  32.9 
 
 
493 aa  247  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.45 
 
 
493 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.63 
 
 
483 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  32.56 
 
 
479 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  31.63 
 
 
475 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.07 
 
 
488 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.07 
 
 
488 aa  246  8e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  31.35 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.19 
 
 
480 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
482 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  33.7 
 
 
489 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
482 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.19 
 
 
480 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.19 
 
 
480 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1097  aldehyde dehydrogenase  31.3 
 
 
490 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.63 
 
 
493 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4370  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  30.87 
 
 
485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194808  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2142  Aldehyde Dehydrogenase  32.1 
 
 
486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.15 
 
 
488 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  30.65 
 
 
484 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  34.07 
 
 
489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  34.07 
 
 
489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  34.07 
 
 
489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.07 
 
 
489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.07 
 
 
489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.29 
 
 
503 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.15 
 
 
489 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.69 
 
 
489 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  33.87 
 
 
483 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  34.63 
 
 
536 aa  243  7e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  33.85 
 
 
489 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  30.46 
 
 
475 aa  243  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3157  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  30.43 
 
 
484 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0316898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.44 
 
 
486 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1988  aldehyde dehydrogenase  30.47 
 
 
484 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>