More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1385 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
524 aa  1080    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  57.45 
 
 
541 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  69.6 
 
 
526 aa  771    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  56.84 
 
 
541 aa  633  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  57.71 
 
 
540 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  54.18 
 
 
542 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  54.18 
 
 
542 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  54.08 
 
 
569 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  55.7 
 
 
541 aa  613  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  55.7 
 
 
541 aa  613  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  53.7 
 
 
542 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  55.13 
 
 
539 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  54.94 
 
 
534 aa  610  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  54.94 
 
 
545 aa  610  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  53.7 
 
 
542 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  53.7 
 
 
542 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  54.94 
 
 
539 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  54.75 
 
 
539 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 
539 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  54.67 
 
 
541 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  54.94 
 
 
540 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  53.71 
 
 
539 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  53.23 
 
 
541 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  55.62 
 
 
536 aa  596  1e-169  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  53.8 
 
 
541 aa  596  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  53.33 
 
 
539 aa  596  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  53.71 
 
 
541 aa  592  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  55.24 
 
 
541 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  54.75 
 
 
541 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  53.33 
 
 
540 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  52.94 
 
 
546 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  55.45 
 
 
541 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  52.02 
 
 
542 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  52.66 
 
 
560 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  55.3 
 
 
459 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  42.71 
 
 
588 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.68 
 
 
479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  33.68 
 
 
479 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.61 
 
 
477 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  33.68 
 
 
479 aa  274  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.68 
 
 
479 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.47 
 
 
479 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.47 
 
 
479 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.47 
 
 
479 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.47 
 
 
479 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.47 
 
 
479 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
479 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  33.68 
 
 
479 aa  270  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.33 
 
 
482 aa  248  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  33.56 
 
 
482 aa  248  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  32.78 
 
 
476 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  33.18 
 
 
466 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.67 
 
 
471 aa  236  7e-61  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  32.75 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.67 
 
 
475 aa  226  7e-58  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.21 
 
 
477 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  32.05 
 
 
472 aa  208  2e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  29.79 
 
 
475 aa  207  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  30.48 
 
 
482 aa  199  7.999999999999999e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  28.75 
 
 
465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  26.83 
 
 
479 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  28.05 
 
 
477 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  25.89 
 
 
475 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  27.89 
 
 
486 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  27.03 
 
 
475 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  27.89 
 
 
486 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  26.95 
 
 
483 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  27.89 
 
 
486 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  27.89 
 
 
486 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  27.89 
 
 
486 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  27.89 
 
 
486 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  27.89 
 
 
486 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  27.89 
 
 
486 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3488  Aldehyde Dehydrogenase  26.58 
 
 
489 aa  177  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  26.54 
 
 
483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  26.54 
 
 
483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  26.15 
 
 
477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  26.34 
 
 
483 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  27.63 
 
 
449 aa  173  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  26.34 
 
 
483 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  26.34 
 
 
483 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  26.34 
 
 
483 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  27.83 
 
 
493 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.24 
 
 
483 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  26.34 
 
 
483 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  27.47 
 
 
482 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  27.71 
 
 
499 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.45 
 
 
483 aa  171  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  26.55 
 
 
468 aa  170  5e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  30.15 
 
 
533 aa  170  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  26.38 
 
 
484 aa  170  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  28.14 
 
 
485 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0759  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  27.89 
 
 
484 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0247006  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3373  Aldehyde Dehydrogenase  25.57 
 
 
532 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  26.13 
 
 
483 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.54 
 
 
483 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  30.06 
 
 
505 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  30.41 
 
 
505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1629  Aldehyde Dehydrogenase  28.29 
 
 
496 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  27.23 
 
 
493 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>