More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1033 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  62.99 
 
 		 539 aa  715    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 541 aa  1106    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  71.72 
 
 		 541 aa  766    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  65.12 
 
 		 539 aa  743    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  63.18 
 
 		 539 aa  717    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  62.99 
 
 		 539 aa  713    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  61.75 
 
 		 542 aa  710    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  61.57 
 
 		 569 aa  704    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  58.3 
 
 		 542 aa  666    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  61 
 
 		 541 aa  713    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  62.99 
 
 		 539 aa  712    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  59.15 
 
 		 541 aa  682    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  65.48 
 
 		 540 aa  730    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  60.11 
 
 		 540 aa  687    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  57.97 
 
 		 536 aa  654    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  61.19 
 
 		 542 aa  705    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  74.68 
 
 		 541 aa  840    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  61.75 
 
 		 542 aa  710    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  59.18 
 
 		 560 aa  636    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  60.81 
 
 		 541 aa  677    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  60.81 
 
 		 541 aa  701    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  61.47 
 
 		 534 aa  695    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  59.4 
 
 		 540 aa  664    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  57.14 
 
 		 526 aa  636    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  64.94 
 
 		 546 aa  748    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  60.63 
 
 		 541 aa  694    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  61.94 
 
 		 542 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  57.45 
 
 		 524 aa  639    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  61.92 
 
 		 541 aa  718    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  64.38 
 
 		 539 aa  733    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  60.81 
 
 		 541 aa  694    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  60.48 
 
 		 545 aa  701    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  61.94 
 
 		 542 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  60.81 
 
 		 541 aa  677    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  60.81 
 
 		 459 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  44.76 
 
 		 588 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.06 
 
 		 479 aa  258  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.44 
 
 		 477 aa  256  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.85 
 
 		 479 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.85 
 
 		 479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.85 
 
 		 479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.44 
 
 		 479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.85 
 
 		 479 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.85 
 
 		 479 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  32.85 
 
 		 479 aa  253  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.23 
 
 		 479 aa  252  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  32.85 
 
 		 479 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.22 
 
 		 479 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.55 
 
 		 482 aa  240  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  32.39 
 
 		 476 aa  237  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  32.34 
 
 		 482 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  31.46 
 
 		 466 aa  236  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.25 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  33.18 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.34 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  31.06 
 
 		 475 aa  223  6e-57  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.95 
 
 		 472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.12 
 
 		 477 aa  219  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  33.73 
 
 		 482 aa  217  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  28.74 
 
 		 468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  28.8 
 
 		 505 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6492  aldehyde dehydrogenase  28.38 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00244112  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  30.79 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  28.22 
 
 		 475 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3157  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  28.05 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0316898 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  30.84 
 
 		 479 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  29.72 
 
 		 476 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1988  aldehyde dehydrogenase  28.38 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  30.84 
 
 		 479 aa  172  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  30.84 
 
 		 479 aa  170  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  30.84 
 
 		 479 aa  170  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  30.61 
 
 		 479 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  30.61 
 
 		 479 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3141  aldehyde dehydrogenase  28.05 
 
 		 484 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3076  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  28.15 
 
 		 484 aa  170  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.20557 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  26.24 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3193  aldehyde dehydrogenase  28.15 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4370  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  27.73 
 
 		 485 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  28.11 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2528  aldehyde dehydrogenase  28.05 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.76 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  30.39 
 
 		 479 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1635  aldehyde dehydrogenase A  30.61 
 
 		 479 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4512  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  27.92 
 
 		 484 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.628578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3133  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  27.92 
 
 		 484 aa  166  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  28.09 
 
 		 502 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3488  Aldehyde Dehydrogenase  30.47 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  28.6 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  25.22 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  29.09 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  28.34 
 
 		 474 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1629  Aldehyde Dehydrogenase  29.78 
 
 		 496 aa  163  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  28.13 
 
 		 474 aa  163  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  28.13 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  28.13 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  28.13 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  28.13 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  28.13 
 
 		 474 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  30.49 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  27.18 
 
 		 475 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>