More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3193 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4512  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  92.36 
 
 
484 aa  922    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.628578 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4370  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  81.61 
 
 
485 aa  808    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194808  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0860  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  67.02 
 
 
484 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000898761  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6228  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  67.42 
 
 
485 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3721  aldehyde dehydrogenase  73.31 
 
 
487 aa  730    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0492  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  67.02 
 
 
484 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3157  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  95.66 
 
 
484 aa  952    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0316898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5877  aldehyde dehydrogenase  70.64 
 
 
480 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4973  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  66.39 
 
 
484 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000556305  normal  0.433203 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1905  aldehyde dehydrogenase family protein  67.02 
 
 
484 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000342687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3076  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  97.52 
 
 
484 aa  968    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.20557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6492  aldehyde dehydrogenase  95.04 
 
 
484 aa  952    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00244112  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0353  aldehyde dehydrogenase  66.81 
 
 
484 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000407244  normal  0.855721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1988  aldehyde dehydrogenase  91.94 
 
 
484 aa  923    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1763  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  67.02 
 
 
484 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217029  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4795  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  68.07 
 
 
483 aa  663    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000133689  hitchhiker  0.00000131204 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2049  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  66.81 
 
 
484 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000445966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3133  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  94.83 
 
 
484 aa  945    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5071  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  67.42 
 
 
485 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000287939  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3141  aldehyde dehydrogenase  95.25 
 
 
484 aa  947    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3221  aldehyde dehydrogenase  70.21 
 
 
488 aa  703    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132306  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4691  aldehyde dehydrogenase  73.31 
 
 
486 aa  732    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1869  putative NADP-dependentglyceraldehyde-3- phosphate dehydrogenase  67.77 
 
 
483 aa  678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000063201  normal  0.209762 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0901  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  67.02 
 
 
484 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.000000741631  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2217  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  67.02 
 
 
484 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000151609  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3428  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  65.97 
 
 
484 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000575813  normal  0.0325207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2528  aldehyde dehydrogenase  95.04 
 
 
484 aa  945    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3072  aldehyde dehydrogenase  66.18 
 
 
483 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000976863  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5184  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  67.23 
 
 
484 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000798563  normal  0.630733 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5295  aldehyde dehydrogenase  66.18 
 
 
484 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000061233  decreased coverage  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3193  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
484 aa  992    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4656  aldehyde dehydrogenase  67.02 
 
 
484 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.0000000188591  normal  0.0270817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1097  aldehyde dehydrogenase  70.8 
 
 
490 aa  700    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0589  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  66.81 
 
 
484 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000137981  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2170  aldehyde dehydrogenase family protein  56.14 
 
 
517 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.212122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0907  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  54.62 
 
 
490 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140416  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0815  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  54.62 
 
 
490 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402156  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4876  aldehyde dehydrogenase  56.75 
 
 
485 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603183  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3677  Aldehyde Dehydrogenase  48.94 
 
 
480 aa  424  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  35.62 
 
 
464 aa  311  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  36.17 
 
 
477 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  37.63 
 
 
480 aa  302  7.000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  35.9 
 
 
475 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  33.68 
 
 
465 aa  300  3e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1421  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
490 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.545693  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  33.55 
 
 
475 aa  299  7e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  34.9 
 
 
479 aa  299  8e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  36.48 
 
 
475 aa  299  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6798  aldehyde dehydrogenase  39.74 
 
 
476 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271512  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0665  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent,putative  37.42 
 
 
472 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  35.67 
 
 
484 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0699  aldehyde dehydrogenase  36.98 
 
 
472 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351901  hitchhiker  0.00852309 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  36.7 
 
 
457 aa  295  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4960  Aldehyde Dehydrogenase  35.57 
 
 
469 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613851  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  34.91 
 
 
477 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.06 
 
 
490 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.95 
 
 
484 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4843  aldehyde dehydrogenase  39.07 
 
 
476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal  0.214894 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  36.4 
 
 
482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  36.84 
 
 
479 aa  286  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3561  aldehyde dehydrogenase  37.23 
 
 
464 aa  286  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.17 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.16 
 
 
486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  36.62 
 
 
482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.26 
 
 
489 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0559  aldehyde dehydrogenase  35.13 
 
 
473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.088227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  35.22 
 
 
466 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  36.95 
 
 
477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  34.4 
 
 
477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.01 
 
 
489 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.05 
 
 
489 aa  282  9e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.05 
 
 
489 aa  282  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.05 
 
 
489 aa  282  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.05 
 
 
489 aa  282  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.84 
 
 
489 aa  282  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.05 
 
 
489 aa  282  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.01 
 
 
489 aa  282  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  36.62 
 
 
479 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  36.62 
 
 
479 aa  281  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  36.62 
 
 
479 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  36.62 
 
 
479 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
489 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.92 
 
 
485 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.89 
 
 
489 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.89 
 
 
489 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.89 
 
 
489 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  35.96 
 
 
479 aa  279  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4288  aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
476 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354203  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  34.77 
 
 
476 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  36.4 
 
 
479 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  36.4 
 
 
479 aa  279  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  36.4 
 
 
479 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  36.4 
 
 
479 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  36.18 
 
 
479 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  35.42 
 
 
468 aa  276  7e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  36.42 
 
 
478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  33.26 
 
 
474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.89 
 
 
509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2296  Aldehyde Dehydrogenase  36.74 
 
 
479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.190281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>