More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7592 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7592  DNA-binding protein HU-alpha  100 
 
 		 58 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7326  histone family protein DNA-binding protein  84 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6261  histone family protein DNA-binding protein  79.25 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.307105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0956  DNA-binding protein HU-alpha  74 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4682  histone family protein DNA-binding protein  74 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0505442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2913  DNA-binding protein HU, form B  60 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.5361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  60 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  61.22 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  60 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  60 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  60 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  60 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  58 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  58 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2337  histone-like DNA-binding protein  56 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000498066  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  50 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  54 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3723  DNA-binding protein HU-beta  52 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  48 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1750  histone-like DNA-binding protein  52 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.519537  normal  0.0235988 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0007  histone-like DNA-binding protein  56 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3694  nucleoid protein HU beta subunit  52 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.566059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  54 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  48 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4704  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  51.02 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  52 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  52 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  52 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  52 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  52 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  52 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  52 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1905  histone family protein DNA-binding protein  52 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173408  hitchhiker  0.000216257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  52 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  49.02 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  48 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0532  histone-like protein  46.55 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4958  histone-like DNA-binding protein  48 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  48 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  44.9 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3460  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0312988  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  50 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  44.9 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  54.17 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  42 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006954  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  44.9 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  54.17 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  44.9 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  44.9 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1866  histone family protein DNA-binding protein  49.02 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0187787  hitchhiker  0.00274705 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  48 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2800  histone family protein DNA-binding protein  46.94 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224088  normal  0.168856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8047  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 232 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8015  histone-like DNA-binding protein  46.94 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  47.06 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0470  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  46 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  46 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2750  DNA-binding protein HU-beta  48 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  46 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  46 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1551  histone-like DNA-binding protein  42 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00525571  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  44.9 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  52.08 
 
 		 91 aa  50.1  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1412  histone-like DNA-binding protein  46.94 
 
 		 91 aa  50.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000277772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1967  histone family protein DNA-binding protein  44 
 
 		 92 aa  50.1  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00606172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  40.82 
 
 		 91 aa  50.1  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  42 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  42 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1533  histone family protein DNA-binding protein  47.06 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.753498  normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  48 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  42 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  42 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  42 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  42 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  42 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  42 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  42 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  42 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  42 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0975  histone family protein DNA-binding protein  44.23 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  43.1 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  42.86 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  42 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  42 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>