83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2543 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2543  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3721  TraR/DksA family transcriptional regulator  79.82 
 
 		 109 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1246  hypothetical protein  77.98 
 
 		 109 aa  173  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00509668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3995  hypothetical protein  77.06 
 
 		 109 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000745487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3636  DnaK suppressor protein  74.31 
 
 		 109 aa  167  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3908  hypothetical protein  74.31 
 
 		 109 aa  167  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000719586 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3653  DnaK suppressor protein  74.31 
 
 		 109 aa  166  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000290902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3946  hypothetical protein  74.31 
 
 		 109 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3939  hypothetical protein  74.04 
 
 		 104 aa  157  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000916453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3745  hypothetical protein  74.31 
 
 		 109 aa  153  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.182224  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4033  hypothetical protein  74.04 
 
 		 104 aa  144  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000167435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2439  TraR/DksA family transcriptional regulator  35 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.734932  normal  0.693819 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  42 
 
 		 243 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  40 
 
 		 243 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  40 
 
 		 243 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.84 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  40 
 
 		 243 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  40 
 
 		 243 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  40 
 
 		 243 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  40 
 
 		 243 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  40 
 
 		 243 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  40 
 
 		 243 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  38 
 
 		 243 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1452  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.94 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0860961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3572  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.73 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.07 
 
 		 275 aa  43.9  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  34.12 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 257 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3640  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.24 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.76 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0703  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5995  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.03 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1823  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.76 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00591197 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0676  hypothetical protein  41.46 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  52.94 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.94 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  52.94 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.94 
 
 		 139 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.94 
 
 		 139 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  51.35 
 
 		 228 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  52.94 
 
 		 139 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0162  DnaK suppressor protein  47.37 
 
 		 137 aa  42  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225781  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.94 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.86 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.94 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0429  hypothetical protein  35 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3488  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  50 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1950  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  34.44 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 140 aa  40.8  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.52 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 229 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1282  zinc finger DksA/TraR C4-type  29.59 
 
 		 152 aa  40.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3085  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0203  RNA polymerase-binding protein DksA  48.65 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3255  DnaK suppressor protein  48.65 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0387  DnaK suppressor protein  48.65 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  48.65 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2675  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.5 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2917  RNA polymerase-binding protein DksA  48.65 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123295  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  34.43 
 
 		 138 aa  40  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2172  DnaK suppressor protein  48.65 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0192  RNA polymerase-binding protein DksA  48.65 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3431  RNA polymerase-binding protein DksA  48.65 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  47.06 
 
 		 138 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.64 
 
 		 114 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3208  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29 
 
 		 218 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000145805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>