24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4249 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  806    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  65.72 
 
 
419 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  66.51 
 
 
420 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  62.66 
 
 
416 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  62.56 
 
 
416 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  64.34 
 
 
419 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  63.29 
 
 
416 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  58.41 
 
 
416 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  65.43 
 
 
419 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  58.65 
 
 
416 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  58.21 
 
 
430 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  60.43 
 
 
419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  56.01 
 
 
420 aa  449  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  57.25 
 
 
419 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  57 
 
 
419 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  63.66 
 
 
425 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  53.41 
 
 
420 aa  388  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  51.34 
 
 
420 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  45.84 
 
 
509 aa  317  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  42.52 
 
 
537 aa  312  9e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  48.16 
 
 
447 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  47.67 
 
 
486 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  47.17 
 
 
486 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  26.04 
 
 
450 aa  178  1e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>