24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1031 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  100 
 
 		 419 aa  807    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  80.05 
 
 		 419 aa  587  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  71.43 
 
 		 416 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  71.08 
 
 		 416 aa  542  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  72.6 
 
 		 419 aa  541  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  70.98 
 
 		 416 aa  528  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  75.62 
 
 		 425 aa  502  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  64.34 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  59.23 
 
 		 416 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  60 
 
 		 419 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  59.71 
 
 		 416 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  58.29 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  56.67 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  58.1 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  57.35 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  58.75 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  54.24 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  50.59 
 
 		 420 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  44.65 
 
 		 509 aa  316  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  41.77 
 
 		 537 aa  298  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  47.72 
 
 		 486 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  47.48 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  47.72 
 
 		 486 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  27.87 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>