24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1562 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  100 
 
 		 420 aa  834    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  83.53 
 
 		 420 aa  674    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  55.37 
 
 		 416 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  55.42 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  55.61 
 
 		 416 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  54.89 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  53.68 
 
 		 419 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  52.97 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  52.85 
 
 		 416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  53.04 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  52.8 
 
 		 416 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  50.59 
 
 		 419 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  51.34 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  51.09 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  51.07 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  49.51 
 
 		 419 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  50.6 
 
 		 420 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  51.38 
 
 		 425 aa  333  5e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  40.27 
 
 		 537 aa  298  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  40.79 
 
 		 509 aa  289  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  42.38 
 
 		 447 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  42.86 
 
 		 486 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  42.86 
 
 		 486 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  26.28 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>