24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1617 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  100 
 
 
537 aa  1096    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  48.19 
 
 
509 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  48.97 
 
 
447 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  49.32 
 
 
486 aa  349  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  49.32 
 
 
486 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  44.34 
 
 
416 aa  339  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  44.57 
 
 
416 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  45.58 
 
 
420 aa  326  8.000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  44.06 
 
 
430 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  44.82 
 
 
419 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  44.52 
 
 
416 aa  307  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  42.66 
 
 
416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  45.25 
 
 
419 aa  298  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  42.06 
 
 
418 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  40.75 
 
 
419 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  41.5 
 
 
420 aa  277  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  40.35 
 
 
420 aa  277  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  41.44 
 
 
420 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  41.53 
 
 
419 aa  276  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  42.15 
 
 
416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  43.47 
 
 
419 aa  266  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  42.37 
 
 
419 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  41.95 
 
 
425 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  32.14 
 
 
450 aa  225  2e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>