24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0189 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  903    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  32.14 
 
 		 537 aa  225  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  29.22 
 
 		 509 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  29.38 
 
 		 420 aa  194  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  27.87 
 
 		 416 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  28.1 
 
 		 416 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  26.8 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  27.66 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  27.06 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  27.42 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  27.58 
 
 		 416 aa  177  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  28.06 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  27.25 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  27.25 
 
 		 486 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  26.57 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  27.87 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  26.34 
 
 		 416 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  27.79 
 
 		 419 aa  160  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  26.85 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  25.81 
 
 		 418 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  27.59 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  26.28 
 
 		 420 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  24.94 
 
 		 419 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  28.21 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>