24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1151 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  816    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  85.34 
 
 		 416 aa  662    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  79.86 
 
 		 416 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  71.01 
 
 		 419 aa  551  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  71.17 
 
 		 419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  67.79 
 
 		 419 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  61.84 
 
 		 418 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  59.13 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  59.13 
 
 		 416 aa  464  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  69.55 
 
 		 425 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  59.61 
 
 		 430 aa  461  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  58.94 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  57.45 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  56.52 
 
 		 419 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  56.59 
 
 		 419 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  56.01 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  55.61 
 
 		 420 aa  405  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  52.26 
 
 		 420 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  42.59 
 
 		 509 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  42.6 
 
 		 537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  45.24 
 
 		 486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  45.08 
 
 		 447 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  45 
 
 		 486 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  27.71 
 
 		 450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>