24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1134 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  825    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  98.56 
 
 		 416 aa  814    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  69.06 
 
 		 420 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  69.25 
 
 		 430 aa  568  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  65.71 
 
 		 419 aa  551  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  65.47 
 
 		 419 aa  535  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  59.4 
 
 		 416 aa  464  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  59.76 
 
 		 416 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  59.66 
 
 		 419 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  58.65 
 
 		 418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  55.61 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  55.99 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  59.59 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  56.01 
 
 		 419 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  57.97 
 
 		 416 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  55.05 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  56.4 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  55.31 
 
 		 425 aa  359  5e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  44.57 
 
 		 537 aa  343  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  46.21 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  47.47 
 
 		 447 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  47.47 
 
 		 486 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  47.47 
 
 		 486 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  28.1 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>