24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3550 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  95.3 
 
 		 447 aa  711    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  100 
 
 		 486 aa  937    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  98.97 
 
 		 486 aa  926    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  56.39 
 
 		 509 aa  472  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  48.43 
 
 		 537 aa  413  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  46.9 
 
 		 416 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  46.67 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  43.96 
 
 		 420 aa  322  8e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  45.45 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  44.5 
 
 		 416 aa  307  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  47.3 
 
 		 419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  45.65 
 
 		 416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  47.11 
 
 		 418 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  45.19 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  43.99 
 
 		 419 aa  299  6e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  47.17 
 
 		 419 aa  297  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  49.03 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  43.76 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  45.29 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  45.37 
 
 		 419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  42.31 
 
 		 420 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  42.69 
 
 		 420 aa  280  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  47.28 
 
 		 425 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  27.98 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>