24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2982 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  852    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  70.81 
 
 
420 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  69.25 
 
 
416 aa  579  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  69.25 
 
 
416 aa  569  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  65 
 
 
419 aa  534  1e-150  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  64.18 
 
 
419 aa  520  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  60.45 
 
 
416 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  60.44 
 
 
416 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  61.18 
 
 
416 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  56.87 
 
 
419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  58.45 
 
 
420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  58.21 
 
 
418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  58.1 
 
 
419 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  59.85 
 
 
419 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  54.89 
 
 
420 aa  431  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  56.53 
 
 
420 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  56.63 
 
 
419 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  57.04 
 
 
425 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  46.7 
 
 
509 aa  339  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  44.06 
 
 
537 aa  321  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  46.02 
 
 
447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  45.3 
 
 
486 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  45.06 
 
 
486 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  27.42 
 
 
450 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>