24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2148 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  813    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  79.86 
 
 		 416 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  80.24 
 
 		 416 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  70.98 
 
 		 419 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  71.17 
 
 		 419 aa  511  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  68.84 
 
 		 419 aa  510  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  63.29 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  59.51 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  61.18 
 
 		 430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  70.63 
 
 		 425 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  59.66 
 
 		 419 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  57.97 
 
 		 416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  57.97 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  56.45 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  56.45 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  56.66 
 
 		 420 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  55.42 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  52.8 
 
 		 420 aa  388  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  44.99 
 
 		 509 aa  333  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  41.7 
 
 		 537 aa  297  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  45.19 
 
 		 486 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  45.19 
 
 		 447 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  44.47 
 
 		 486 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  27.44 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>