24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0028 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  822    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  97.61 
 
 		 419 aa  786    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  66.9 
 
 		 420 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  65.95 
 
 		 416 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  65.71 
 
 		 416 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  65 
 
 		 430 aa  522  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  57.43 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  57.82 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  58.64 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  57.25 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  59.09 
 
 		 419 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  55.58 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  56.45 
 
 		 416 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  53.68 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  53.61 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  54.57 
 
 		 419 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  53.24 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  55.22 
 
 		 425 aa  352  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  44.82 
 
 		 537 aa  311  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  45.64 
 
 		 509 aa  306  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  45.52 
 
 		 447 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  44.31 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  44.31 
 
 		 486 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  27.66 
 
 		 450 aa  179  9e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>