220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3810 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3810  cation efflux protein  100 
 
 		 221 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4223  cation efflux protein  74.89 
 
 		 219 aa  314  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1618  cation efflux protein  89.59 
 
 		 223 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0119724  normal  0.538573 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5957  cation efflux protein  87.33 
 
 		 221 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.553613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4278  cation efflux protein  97.74 
 
 		 221 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0889798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3969  cation efflux protein  86.43 
 
 		 221 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4398  cation efflux protein  86.43 
 
 		 221 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  37.44 
 
 		 385 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 404 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  36.41 
 
 		 384 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 404 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0117  cation diffusion facilitator family transporter  37.44 
 
 		 400 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  36.41 
 
 		 385 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  36.41 
 
 		 385 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  36.41 
 
 		 385 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0399  cation diffusion facilitator family transporter  36.14 
 
 		 418 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329701  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2906  cation efflux family protein  36.45 
 
 		 396 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3403  cation efflux family protein  36.45 
 
 		 396 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.843377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1635  cation efflux family protein  36.45 
 
 		 396 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.504056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2966  cation efflux family protein  36.45 
 
 		 396 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0047  cation efflux family protein  36.45 
 
 		 396 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3154  cation efflux family protein  36.45 
 
 		 418 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 		 337 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3825  cation efflux family protein  36.45 
 
 		 396 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3907  cation efflux family protein  36.45 
 
 		 396 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  31.86 
 
 		 318 aa  94.7  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4320  cation (Co++/Zn++/Cd++) efflux protein  35.5 
 
 		 414 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5408  cation efflux protein  35.11 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362512  normal  0.663662 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  31.94 
 
 		 298 aa  89  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  32.73 
 
 		 318 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  32.79 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  36.28 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  34.52 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  36.98 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  36.98 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  35.14 
 
 		 389 aa  82.4  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  33.49 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  33.5 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  34.52 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  33.86 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2941  cation diffusion facilitator family transporter  34.52 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1675  cation diffusion facilitator family transporter  34.52 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.282896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1200  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.91 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010126  normal  0.466724 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  31.5 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3077  hypothetical protein  38.1 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  29.28 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  34.12 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  29.59 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  33.84 
 
 		 303 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 		 320 aa  71.6  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.67 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  28.8 
 
 		 391 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  28.8 
 
 		 391 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  21.98 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  26.7 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  28.5 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  25.65 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  26.14 
 
 		 380 aa  65.5  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  25.13 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  26.09 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  24.32 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  31.28 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1511  cation diffusion facilitator family transporter  34.94 
 
 		 314 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242761  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3258  cation diffusion facilitator family transporter  32.08 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  27.46 
 
 		 313 aa  62  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  25.27 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  30.57 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  27.65 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  32.85 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  32.11 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  25 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  33.14 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  25 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  25 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  25 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  25 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  24.31 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  25.31 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  23.81 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  23.76 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  30.85 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  25.28 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  26.56 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  26.56 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  26.56 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  25.13 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  31.55 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  29.3 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  25.25 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  32.93 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45119  predicted protein  27.8 
 
 		 591 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  31.55 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2147  cation efflux system protein  27.67 
 
 		 380 aa  55.1  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.809019  normal  0.389636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  30.23 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>