More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1712 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1712  50S ribosomal protein L22  100 
 
 
119 aa  234  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.935527  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0259  ribosomal protein L22  89.92 
 
 
119 aa  187  4e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  70.69 
 
 
121 aa  166  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  73.77 
 
 
122 aa  165  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  70.69 
 
 
123 aa  160  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  68.97 
 
 
121 aa  158  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  71.31 
 
 
122 aa  157  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  68.1 
 
 
121 aa  156  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  71.07 
 
 
121 aa  154  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  69.83 
 
 
122 aa  152  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  65.22 
 
 
125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  67.26 
 
 
126 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  63.72 
 
 
117 aa  144  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  63.56 
 
 
125 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  62.28 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  55.08 
 
 
113 aa  123  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  58.47 
 
 
113 aa  123  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  55.65 
 
 
113 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  57.63 
 
 
117 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  56.41 
 
 
114 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  60 
 
 
281 aa  121  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 
158 aa  121  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  56.03 
 
 
113 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  58.41 
 
 
133 aa  120  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  55.93 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  57.52 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  54.17 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  55.93 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  55.93 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  55.93 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  57.52 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  54.17 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  56.78 
 
 
122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  54.17 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  55.93 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  59.46 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  55.93 
 
 
113 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  55.93 
 
 
113 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  55.93 
 
 
113 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  55.93 
 
 
113 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  55.93 
 
 
113 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  57.02 
 
 
140 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  56.52 
 
 
136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  55.08 
 
 
113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 
146 aa  115  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  54.39 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  56.9 
 
 
125 aa  114  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
152 aa  114  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  57.01 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  54.39 
 
 
114 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  53.85 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  53.51 
 
 
114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  53.33 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  55.08 
 
 
113 aa  111  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  55.08 
 
 
113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  53.7 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  57.52 
 
 
158 aa  110  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  52.54 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  53.39 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  53.1 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  57.89 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  51.69 
 
 
113 aa  106  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  48.31 
 
 
113 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  52.99 
 
 
110 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  50.86 
 
 
111 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  50.86 
 
 
116 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  49.14 
 
 
113 aa  104  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2902  ribosomal protein L22  50.43 
 
 
113 aa  104  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  50 
 
 
112 aa  103  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  45.22 
 
 
110 aa  103  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  50.43 
 
 
118 aa  103  8e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  51.72 
 
 
111 aa  103  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  53.15 
 
 
115 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  47.79 
 
 
111 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  48.25 
 
 
109 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  47.79 
 
 
111 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  51.3 
 
 
165 aa  101  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
111 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
111 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  48.7 
 
 
110 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  45.61 
 
 
117 aa  101  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  52.21 
 
 
111 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  47.79 
 
 
119 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  53.1 
 
 
111 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  50.88 
 
 
110 aa  100  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  45.61 
 
 
114 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  46.85 
 
 
119 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  46.55 
 
 
111 aa  99.4  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  46.55 
 
 
111 aa  99.4  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  50.88 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  44.35 
 
 
149 aa  99  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0936  ribosomal protein L22  54.31 
 
 
130 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127783  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  47.41 
 
 
113 aa  99  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  46.96 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  47.01 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  46.09 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0438  50S ribosomal protein L22  50.44 
 
 
111 aa  98.2  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00481057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4348  ribosomal protein L22  43.86 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000469697  normal  0.116233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  49.56 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>