153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6168 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  100 
 
 
349 aa  687    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  72.86 
 
 
302 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  60.38 
 
 
346 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  61.1 
 
 
340 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  72.86 
 
 
330 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  61.65 
 
 
332 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  63.74 
 
 
329 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0326  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  43.73 
 
 
291 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256258  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  38.55 
 
 
291 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  41.53 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6699  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  40 
 
 
324 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1427  cell division protein FtsQ, putative  37.59 
 
 
288 aa  185  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1384  putative cell division protein FtsQ  37.22 
 
 
295 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3174  cell division protein FtsQ  41.3 
 
 
312 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0135629  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  40.89 
 
 
312 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.351672  normal  0.0843498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  34.59 
 
 
310 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2076  cell division protein FtsQ  37.79 
 
 
309 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000439977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2847  cell division protein FtsQ  36.47 
 
 
310 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  35.61 
 
 
309 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.53 
 
 
327 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1748  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.85 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3131  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  39.27 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.4 
 
 
334 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  36 
 
 
308 aa  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2352  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  44.28 
 
 
317 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.439239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7438  cell division protein FtsQ  38.85 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  40.59 
 
 
331 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  30.69 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  34.78 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.07 
 
 
304 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3166  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  35.42 
 
 
382 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2073  cell division protein FtsQ  33.87 
 
 
299 aa  113  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.313808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  32.83 
 
 
303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0067  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.5 
 
 
292 aa  96.3  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2418  putative cell division protein FtsQ  30.65 
 
 
297 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000895115  normal  0.230977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2752  cell division protein FtsQ  28.81 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0687  cell division protein FtsQ  26.37 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0983299  decreased coverage  0.000241 
 
 
-
 
NC_002978  WD0096  cell division protein FtsQ, putative  28.14 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0666  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.19 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00317197  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0744  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.5 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0312415  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0337  putative cell division protein FtsQ  26.16 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0669  cell division protein FtsQ  28.57 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.809619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  31.03 
 
 
627 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0788  cell division protein FtsQ  22.36 
 
 
308 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.290421  normal  0.28339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0698  cell division protein FtsQ  21.67 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0749  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.82 
 
 
273 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2112  cell division septal protein FtsQ  22.36 
 
 
308 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2449  cell division protein FtsQ  27.94 
 
 
279 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0699952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3970  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.87 
 
 
275 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.035895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0512  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.23 
 
 
274 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0495  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.23 
 
 
274 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1633  cell division protein FtsQ  35.71 
 
 
249 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.317189 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3285  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.57 
 
 
274 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.098326  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3892  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.82 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.880644  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0953  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.97 
 
 
279 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.358047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3832  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  33.33 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0488  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.25 
 
 
362 aa  58.5  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000268225  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3809  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.51 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000142789  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1116  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.14 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00697393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3776  cell division protein FtsQ  33.64 
 
 
293 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1202  cell division protein FtsQ, putative  38.64 
 
 
285 aa  56.6  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.130482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3916  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.46 
 
 
270 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2857  cell division protein FtsQ  22.97 
 
 
265 aa  55.8  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3802  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.19 
 
 
256 aa  56.2  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0128831  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3414  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.11 
 
 
263 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0285361  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0749  cell division protein FtsQ, putative  26.28 
 
 
463 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00294566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1078  cell division protein FtsQ  26.17 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0136029  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09470  cell division septal protein  32.5 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000495605  normal  0.0238077 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2092  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.43 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.995763  hitchhiker  0.0000000659531 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0829  cell division septal protein-like protein  24.77 
 
 
249 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0862377  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2604  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.62 
 
 
276 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2087  cell division protein FtsQ  26.47 
 
 
263 aa  53.9  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.588433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2198  cell division septal protein FtsQ  26.55 
 
 
282 aa  53.5  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000214493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0412  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.93 
 
 
254 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.466864  hitchhiker  0.00145589 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0847  cell division protein FtsQ  24.65 
 
 
261 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0360907  normal  0.845904 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2112  cell division protein FtsQ  26.74 
 
 
248 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4489  cell division protein FtsQ  28.87 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681161  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0639  cell division protein FtsQ  23.3 
 
 
280 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000184858  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1243  cell division protein FtsQ  28.48 
 
 
439 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00538458  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1268  cell division protein FtsQ  28.48 
 
 
439 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0579703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4531  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.09 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0127742  hitchhiker  0.000127547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0851  chaperonin Cpn60/TCP-1  23.53 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.127237  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1022  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  21.05 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00172574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1602  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.21 
 
 
256 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1893  cell division protein FtsQ  30.59 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3472  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.48 
 
 
274 aa  49.7  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350716  normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0143  cell division protein FtsQ  21.95 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216821  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0147  cell division protein FtsQ  21.95 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183403  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1826  cell division protein FtsQ  26 
 
 
248 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0143  cell division protein FtsQ  21.95 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00198063  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3451  cell division protein FtsQ  28.73 
 
 
254 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.188936  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0148  cell division protein FtsQ  21.95 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000728019  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08880  cell division septal protein  31.31 
 
 
277 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0014958  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13280  Cell division protein FtsQ  24.58 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.021703  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3453  cell division septal protein-like  19.86 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3568  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.29 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00488652  hitchhiker  0.0000000422237 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2558  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.74 
 
 
255 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00250517  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1968  cell division protein  22.16 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00917782  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0228  cell division protein FtsQ  22.16 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000146493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3735  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.74 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0240559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>