128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2002 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  100 
 
 
332 aa  661    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  86.45 
 
 
330 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  81.33 
 
 
329 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  74.37 
 
 
302 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  71.76 
 
 
349 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  57.97 
 
 
340 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  57.55 
 
 
346 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0326  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  41.76 
 
 
291 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256258  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  36.4 
 
 
291 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  34.95 
 
 
309 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.04 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.351672  normal  0.0843498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3174  cell division protein FtsQ  39.04 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0135629  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3131  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  38.6 
 
 
312 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_004310  BR1427  cell division protein FtsQ, putative  37.59 
 
 
288 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1384  putative cell division protein FtsQ  37.22 
 
 
295 aa  168  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6699  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.99 
 
 
324 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1748  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.74 
 
 
295 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2352  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.66 
 
 
317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.439239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2076  cell division protein FtsQ  37.2 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000439977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  34.96 
 
 
326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  37.6 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2847  cell division protein FtsQ  35.05 
 
 
310 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  35.29 
 
 
310 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.05 
 
 
327 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7438  cell division protein FtsQ  39.03 
 
 
327 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.2 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  37.16 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  32.74 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32 
 
 
304 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2073  cell division protein FtsQ  32.22 
 
 
299 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.313808 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  32.26 
 
 
312 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  30.81 
 
 
303 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3166  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.35 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0067  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34 
 
 
292 aa  95.9  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2752  cell division protein FtsQ  28.99 
 
 
311 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2418  putative cell division protein FtsQ  40.85 
 
 
297 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000895115  normal  0.230977 
 
 
-
 
NC_002978  WD0096  cell division protein FtsQ, putative  25.93 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0687  cell division protein FtsQ  27.85 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0983299  decreased coverage  0.000241 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0337  putative cell division protein FtsQ  26.77 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0744  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.33 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0312415  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1633  cell division protein FtsQ  36.64 
 
 
249 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.317189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2857  cell division protein FtsQ  24.5 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0666  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.57 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00317197  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0669  cell division protein FtsQ  24.75 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.809619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3970  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.87 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.035895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3285  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.37 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.098326  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0788  cell division protein FtsQ  24 
 
 
308 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.290421  normal  0.28339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  29.17 
 
 
627 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4489  cell division protein FtsQ  35.64 
 
 
340 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681161  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2112  cell division septal protein FtsQ  31.68 
 
 
308 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0698  cell division protein FtsQ  23.76 
 
 
304 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0512  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.42 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2092  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.3 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.995763  hitchhiker  0.0000000659531 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2198  cell division septal protein FtsQ  32.26 
 
 
282 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000214493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0495  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.42 
 
 
274 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09470  cell division septal protein  34.29 
 
 
285 aa  53.9  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000495605  normal  0.0238077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0953  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.53 
 
 
279 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.358047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3892  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.94 
 
 
277 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.880644  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0639  cell division protein FtsQ  25.38 
 
 
280 aa  53.1  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000184858  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0847  cell division protein FtsQ  28.69 
 
 
261 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0360907  normal  0.845904 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0851  chaperonin Cpn60/TCP-1  23.39 
 
 
285 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.127237  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3832  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.84 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2265  cell division protein FtsQ  24.2 
 
 
243 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.245819  hitchhiker  0.00532421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3776  cell division protein FtsQ  30.84 
 
 
293 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2449  cell division protein FtsQ  25.51 
 
 
279 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0699952  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3916  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.91 
 
 
270 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0140  cell division protein FtsQ  22.56 
 
 
276 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467459  normal  0.392627 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0749  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.34 
 
 
273 aa  49.3  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0148  cell division protein FtsQ  24.1 
 
 
276 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000728019  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0143  cell division protein FtsQ  24.1 
 
 
276 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00198063  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0143  cell division protein FtsQ  24.1 
 
 
276 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216821  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0147  cell division protein FtsQ  24.1 
 
 
276 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183403  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3495  cell division protein FtsQ  23.6 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0823778  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1045  cell division protein FtsQ  25.55 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00015927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3802  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.24 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0128831  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2087  cell division protein FtsQ  26.26 
 
 
263 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.588433  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0488  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  23.35 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000268225  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2976  cell division protein FtsQ  22.58 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2642  cell division protein FtsQ  25.17 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1078  cell division protein FtsQ  24.86 
 
 
267 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0136029  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0829  cell division septal protein-like protein  20.95 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0862377  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3414  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.71 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0285361  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.5 
 
 
226 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000621629  unclonable  0.00000000000366922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0412  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.16 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.466864  hitchhiker  0.00145589 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1968  cell division protein  24.47 
 
 
243 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00917782  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0228  cell division protein FtsQ  24.47 
 
 
243 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000146493  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1116  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.45 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00697393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2604  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.67 
 
 
276 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3809  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.84 
 
 
262 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000142789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4531  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.16 
 
 
218 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0127742  hitchhiker  0.000127547 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08880  cell division septal protein  33.33 
 
 
277 aa  46.6  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0014958  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13280  Cell division protein FtsQ  30 
 
 
286 aa  46.2  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.021703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4099  cell division protein FtsQ  31.65 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4670  cell division protein FtsQ  31.65 
 
 
288 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000533312  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0357  cell division protein FtsQ  24.05 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3453  cell division septal protein-like  22.52 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3568  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.95 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00488652  hitchhiker  0.0000000422237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3451  cell division protein FtsQ  31.87 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.188936  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3384  cell division protein FtsQ  25.45 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000592378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4405  cell division protein FtsQ, putative  31.65 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>