52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2112 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2112  cell division septal protein FtsQ  100 
 
 
308 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0788  cell division protein FtsQ  99.03 
 
 
308 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.290421  normal  0.28339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0698  cell division protein FtsQ  90.26 
 
 
304 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4489  cell division protein FtsQ  50.35 
 
 
340 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681161  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0687  cell division protein FtsQ  51.36 
 
 
299 aa  259  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0983299  decreased coverage  0.000241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2418  putative cell division protein FtsQ  43.82 
 
 
297 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000895115  normal  0.230977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2752  cell division protein FtsQ  43.59 
 
 
311 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.93 
 
 
334 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1748  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.96 
 
 
295 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1384  putative cell division protein FtsQ  32.67 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1427  cell division protein FtsQ, putative  29.8 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387977  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  28.95 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3131  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.71 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2352  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.36 
 
 
317 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.439239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3174  cell division protein FtsQ  32.48 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0135629  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.05 
 
 
312 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.351672  normal  0.0843498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3166  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.24 
 
 
382 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  27.78 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  28.92 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7438  cell division protein FtsQ  35.98 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  33.14 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  29.87 
 
 
303 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  29.3 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  27.43 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.91 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2847  cell division protein FtsQ  25.77 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0326  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.1 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256258  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  25.34 
 
 
346 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6699  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.32 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.33 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2076  cell division protein FtsQ  24.79 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000439977 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  25.98 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0096  cell division protein FtsQ, putative  25.19 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  25.81 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  22.36 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  23.6 
 
 
329 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  23.6 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0067  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.08 
 
 
292 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2073  cell division protein FtsQ  26.72 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.313808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  23.6 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0669  cell division protein FtsQ  25.28 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.809619  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  27.9 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  25.74 
 
 
320 aa  53.1  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0337  putative cell division protein FtsQ  27.23 
 
 
271 aa  53.1  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004488  cell division protein FtsQ  28.28 
 
 
260 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00754349  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00904  hypothetical protein  29.66 
 
 
260 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1078  cell division protein FtsQ  26.79 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0136029  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1977  cell division protein FtsQ  25.93 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00013353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3125  cell division protein FtsQ  27.19 
 
 
300 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0491  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.29 
 
 
250 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00415174  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0466  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.29 
 
 
250 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0206402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2833  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.47 
 
 
250 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000280119  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>