104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3942 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 		 304 aa  594  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  51.97 
 
 		 312 aa  238  6.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  36.46 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  32 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  32.33 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  30.13 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  31.42 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  35.64 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  32 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  33 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  33.05 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0326  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.6 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256258  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.22 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.5 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.351672  normal  0.0843498 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  30.14 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3174  cell division protein FtsQ  33.5 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0135629  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  29.65 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3131  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  34 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.46 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2073  cell division protein FtsQ  29.83 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.313808 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3166  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.35 
 
 		 382 aa  98.2  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2352  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.5 
 
 		 317 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.439239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7438  cell division protein FtsQ  33.33 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2418  putative cell division protein FtsQ  32.53 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000895115  normal  0.230977 
 
 
-
 
NC_004310  BR1427  cell division protein FtsQ, putative  30.5 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1384  putative cell division protein FtsQ  30 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  30.41 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2847  cell division protein FtsQ  30.41 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6699  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.02 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1748  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  27.36 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  26.73 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2076  cell division protein FtsQ  25.32 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000439977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0687  cell division protein FtsQ  31.33 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0983299  decreased coverage  0.000241 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4489  cell division protein FtsQ  29.17 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2752  cell division protein FtsQ  31.88 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.417111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0096  cell division protein FtsQ, putative  28.17 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0788  cell division protein FtsQ  33.33 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.290421  normal  0.28339 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0067  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.21 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0698  cell division protein FtsQ  32.16 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2112  cell division septal protein FtsQ  33.33 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0337  putative cell division protein FtsQ  26.13 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0669  cell division protein FtsQ  26.16 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.809619  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0586  cell division protein FtsQ  30.99 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000143691  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0123  cell division protein FtsQ  39.09 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0118462  normal  0.0546575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2857  cell division protein FtsQ  26.17 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516173  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2664  cell division protein FtsQ  28.49 
 
 		 239 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2534  cell division protein FtsQ  28.49 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2197  cell division protein FtsQ  43.24 
 
 		 240 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0102896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0639  cell division protein FtsQ  26.54 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000184858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2490  cell division protein FtsQ  28.8 
 
 		 236 aa  52.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0749  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.68 
 
 		 232 aa  52.4  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.77 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3437  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.75 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0143  cell division protein FtsQ  26.54 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00198063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0143  cell division protein FtsQ  26.54 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216821  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0147  cell division protein FtsQ  26.54 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0148  cell division protein FtsQ  26.54 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000728019  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0140  cell division protein FtsQ  26.54 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467459  normal  0.392627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13280  Cell division protein FtsQ  30.38 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.021703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1340  cell division protein FtsQ  31.54 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226381  normal  0.0690806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4099  cell division protein FtsQ  32.67 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2873  cell division protein FtsQ  31.07 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1572  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.04 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3285  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.53 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.098326  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4509  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.77 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1286  cell division protein FtsQ  27.45 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4405  cell division protein FtsQ, putative  32.67 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4670  cell division protein FtsQ  31.68 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000533312  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3211  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.04 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25033  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4384  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.77 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00442513  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4981  cell division protein FtsQ  32.32 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1116  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  23.3 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00697393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57300  cell division protein FtsQ  32.32 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0925  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.05 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316066  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3970  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.63 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.035895  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0453  cell division protein FtsQ  36.45 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0577053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2198  cell division septal protein FtsQ  26.97 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000214493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0780  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.4 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0258619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0847  cell division protein FtsQ  44.26 
 
 		 261 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0360907  normal  0.845904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3453  cell division septal protein-like  25.35 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12181  cell division protein ftsQ  30.57 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000903936  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00094  membrane anchored protein involved in growth of wall at septum  25.66 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158467  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3521  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.45 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0099  cell division protein FtsQ  25.66 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0095  cell division protein FtsQ  25.66 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000354285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0098  cell division protein FtsQ  25.66 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000317726  normal  0.746071 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0086  cell division protein FtsQ  25.66 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000154826  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0101  cell division protein FtsQ  25.66 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00093  hypothetical protein  25.66 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.015321  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1633  cell division protein FtsQ  29.61 
 
 		 249 aa  45.8  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.317189 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0098  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  21.39 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3507  cell division protein FtsQ  25 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000541372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1409  polypeptide-transport-associated domain-containing protein FtsQ-type  31.78 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.571573  normal  0.075742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3564  cell division protein FtsQ  25 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0148979  normal  0.0119614 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2857  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.51 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22780  cell division septal protein  30 
 
 		 408 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0151771 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0851  chaperonin Cpn60/TCP-1  22.15 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.127237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2990  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.6 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  0.0214492 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>