100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2947 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
312 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.351672  normal  0.0843498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3174  cell division protein FtsQ  99.36 
 
 
312 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0135629  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3131  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  96.47 
 
 
312 aa  567  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2352  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  70.03 
 
 
317 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.439239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6699  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  60.8 
 
 
324 aa  338  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7438  cell division protein FtsQ  58.1 
 
 
327 aa  315  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  51.84 
 
 
326 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  49.81 
 
 
327 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  40.18 
 
 
346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  46.39 
 
 
340 aa  216  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  41.02 
 
 
349 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  43.09 
 
 
302 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  40.07 
 
 
330 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  38.84 
 
 
332 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0326  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  42.48 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256258  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  39.84 
 
 
329 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1384  putative cell division protein FtsQ  36.68 
 
 
295 aa  159  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  37.46 
 
 
291 aa  158  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1427  cell division protein FtsQ, putative  36.27 
 
 
288 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387977  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1748  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.29 
 
 
295 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.89 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  38.81 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2847  cell division protein FtsQ  34.8 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  33.58 
 
 
309 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2076  cell division protein FtsQ  34.1 
 
 
309 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000439977 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  32.23 
 
 
308 aa  133  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  36.29 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.64 
 
 
304 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  33.61 
 
 
303 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2073  cell division protein FtsQ  33.47 
 
 
299 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.313808 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  30.45 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0687  cell division protein FtsQ  33.33 
 
 
299 aa  93.2  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0983299  decreased coverage  0.000241 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4489  cell division protein FtsQ  32.56 
 
 
340 aa  90.1  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681161  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2112  cell division septal protein FtsQ  31.23 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0698  cell division protein FtsQ  30.67 
 
 
304 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0788  cell division protein FtsQ  31.95 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.290421  normal  0.28339 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3166  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.19 
 
 
382 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  28.14 
 
 
320 aa  85.9  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2418  putative cell division protein FtsQ  29.58 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000895115  normal  0.230977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2752  cell division protein FtsQ  34 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0096  cell division protein FtsQ, putative  25 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0067  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.85 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0337  putative cell division protein FtsQ  25.39 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0847  cell division protein FtsQ  24.42 
 
 
261 aa  59.3  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0360907  normal  0.845904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3970  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.72 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.035895  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0744  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.47 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0312415  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0512  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  24.42 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0495  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  23.96 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3285  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.86 
 
 
274 aa  53.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.098326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  23.6 
 
 
627 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13280  Cell division protein FtsQ  28.73 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.021703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1045  cell division protein FtsQ  27.06 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00015927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0666  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  22.33 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00317197  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0669  cell division protein FtsQ  27.32 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.809619  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0639  cell division protein FtsQ  25.61 
 
 
280 aa  49.7  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000184858  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0140  cell division protein FtsQ  28.75 
 
 
276 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467459  normal  0.392627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2198  cell division septal protein FtsQ  25.3 
 
 
282 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000214493  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3809  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.92 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000142789  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0148  cell division protein FtsQ  28.12 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000728019  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0143  cell division protein FtsQ  28.12 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216821  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0953  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.31 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.358047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0143  cell division protein FtsQ  28.12 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00198063  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0147  cell division protein FtsQ  28.12 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183403  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2670  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.79 
 
 
250 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2604  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  24.76 
 
 
276 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0925  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.63 
 
 
288 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316066  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3467  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.79 
 
 
250 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000457508  hitchhiker  0.00184571 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2558  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.44 
 
 
255 aa  45.8  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00250517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0465  cell division protein FtsQ  24.86 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0489  putative cell division transmembrane protein, FtsQ  26.79 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0227105  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0851  chaperonin Cpn60/TCP-1  24.02 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.127237  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3923  cell division protein FtsQ  21.88 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000593688 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3954  cell division protein FtsQ  21.88 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00730179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3759  cell division protein FtsQ  21.88 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.809963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3650  cell division protein  21.88 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00450755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3667  cell division protein  21.88 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4047  cell division protein FtsQ  21.88 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000837674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4009  cell division protein FtsQ  22.66 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.127118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0764  cell division protein FtsQ  24.48 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.691336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3735  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.88 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0240559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00093  hypothetical protein  28.77 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.015321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3961  cell division protein FtsQ  21.88 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000432295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1232  cell division protein FtsQ  21.88 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00510025  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3507  cell division protein FtsQ  28.77 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000541372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0101  cell division protein FtsQ  28.77 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0086  cell division protein FtsQ  28.77 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000154826  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0098  cell division protein FtsQ  28.77 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000317726  normal  0.746071 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3564  cell division protein FtsQ  28.77 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0148979  normal  0.0119614 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0095  cell division protein FtsQ  28.77 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000354285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0099  cell division protein FtsQ  28.77 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153055  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0749  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.27 
 
 
232 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116694  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00094  membrane anchored protein involved in growth of wall at septum  28.77 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158467  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0491  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.14 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00415174  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0466  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.14 
 
 
250 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0206402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3589  cell division protein FtsQ  30.12 
 
 
274 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2642  cell division protein FtsQ  25.97 
 
 
256 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3832  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.52 
 
 
294 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1633  cell division protein FtsQ  29.84 
 
 
249 aa  42.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.317189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3648  cell division protein FtsQ  25.14 
 
 
250 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0726048  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0899  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.87 
 
 
256 aa  42.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>