157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0412 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0412  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.466864  hitchhiker  0.00145589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4531  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  88.53 
 
 		 218 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0127742  hitchhiker  0.000127547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3809  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  74.8 
 
 		 262 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000142789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3451  cell division protein FtsQ  74.41 
 
 		 254 aa  380  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.188936  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4217  cell division protein FtsQ  64.8 
 
 		 262 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  64.4 
 
 		 262 aa  340  9e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000561241  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0415  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  64 
 
 		 262 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235658  hitchhiker  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0404  cell division protein FtsQ  63.6 
 
 		 262 aa  338  5e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00313866  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0388  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  66.67 
 
 		 249 aa  334  7e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.109832  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3568  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  66.24 
 
 		 249 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00488652  hitchhiker  0.0000000422237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3741  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  66.24 
 
 		 249 aa  332  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0016419  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0489  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  65.4 
 
 		 249 aa  328  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0357  cell division protein FtsQ  62.4 
 
 		 250 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3802  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  63.35 
 
 		 256 aa  327  9e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0128831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0429  cell division protein FtsQ  64.98 
 
 		 249 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000800756  hitchhiker  0.0000000000534186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0356  cell division protein FtsQ  61 
 
 		 274 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  hitchhiker  0.000649691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3515  cell division protein FtsQ  42.48 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228011  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3384  cell division protein FtsQ  42.48 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000592378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3589  cell division protein FtsQ  40.95 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4462  cell division protein FtsQ  37.96 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24194  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3516  cell division protein FtsQ  40.65 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.320398  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3777  cell division protein FtsQ  40.95 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0326352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0613  cell division protein FtsQ  39.66 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0180301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0764  cell division protein FtsQ  41.05 
 
 		 283 aa  175  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.691336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0140  cell division protein FtsQ  39.74 
 
 		 276 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467459  normal  0.392627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0143  cell division protein FtsQ  39.74 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00198063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0148  cell division protein FtsQ  39.74 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000728019  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0143  cell division protein FtsQ  39.74 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216821  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0147  cell division protein FtsQ  39.74 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0639  cell division protein FtsQ  38.3 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000184858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2642  cell division protein FtsQ  37.08 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0651  cell division protein FtsQ  39.22 
 
 		 284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0684604  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1150  cell division protein FtsQ  36.36 
 
 		 245 aa  161  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.460682  normal  0.89976 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3507  cell division protein FtsQ  38.26 
 
 		 276 aa  158  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000541372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3564  cell division protein FtsQ  38.26 
 
 		 276 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0148979  normal  0.0119614 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00094  membrane anchored protein involved in growth of wall at septum  38.26 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0101  cell division protein FtsQ  38.26 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00093  hypothetical protein  38.26 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.015321  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0086  cell division protein FtsQ  38.26 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000154826  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0098  cell division protein FtsQ  38.26 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000317726  normal  0.746071 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0099  cell division protein FtsQ  38.26 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0095  cell division protein FtsQ  38.26 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000354285  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004488  cell division protein FtsQ  36.96 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00754349  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2087  cell division protein FtsQ  37.22 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.588433  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00904  hypothetical protein  36.09 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1977  cell division protein FtsQ  38.46 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00013353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0605  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  35.35 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1966  cell division protein FtsQ  35.2 
 
 		 278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2045  cell division protein  35.2 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000010685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0465  cell division protein FtsQ  36.12 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04364  cell division protein FtsQ  32.14 
 
 		 273 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.749304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13280  Cell division protein FtsQ  36.41 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.021703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0773  cell division protein FtsQ  34.78 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0728001  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0123  cell division protein FtsQ  37.38 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0118462  normal  0.0546575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2857  cell division protein FtsQ  29.87 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516173  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3495  cell division protein FtsQ  37.93 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0823778  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.02 
 
 		 289 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4670  cell division protein FtsQ  34.02 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000533312  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2449  cell division protein FtsQ  33.33 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0699952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0925  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.5 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316066  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2189  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.48 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1968  cell division protein  32.13 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00917782  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0228  cell division protein FtsQ  32.13 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000146493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4405  cell division protein FtsQ, putative  34.62 
 
 		 289 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4509  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1340  cell division protein FtsQ  33.33 
 
 		 289 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226381  normal  0.0690806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4384  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00442513  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4099  cell division protein FtsQ  37 
 
 		 289 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2265  cell division protein FtsQ  32.57 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.245819  hitchhiker  0.00532421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4981  cell division protein FtsQ  33.05 
 
 		 287 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57300  cell division protein FtsQ  32.64 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0851  chaperonin Cpn60/TCP-1  30.26 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.127237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3424  cell division protein FtsQ  34.33 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.291979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3541  cell division protein FtsQ  32.16 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3522  cell division protein FtsQ  32.16 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3547  cell division protein FtsQ  32.16 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0361  cell division protein  28.74 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00756063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1121  cell division protein FtsQ  31.66 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2670  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.32 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3414  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.47 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0285361  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0922  cell division protein FtsQ  32.17 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.130342  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2197  cell division protein FtsQ  32.65 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0102896  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2534  cell division protein FtsQ  32.21 
 
 		 239 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2548  cell division protein FtsQ  31.66 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0202  cell division protein FtsQ  30.13 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3422  cell division protein FtsQ  31.82 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0109041  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0381  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.13 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00296108  normal  0.100496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2187  cell division protein FtsQ  33.48 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0469  cell division protein FtsQ  31.66 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1328  cell division protein FtsQ  31.66 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64132  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3235  cell division protein FtsQ  31.66 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2664  cell division protein FtsQ  31.73 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03255  cell division protein  40.56 
 
 		 173 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0023764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3648  cell division protein FtsQ  30.15 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0726048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0080  cell division protein FtsQ  30.15 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0562  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.15 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000118415  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0533  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.15 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000284929  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1078  cell division protein FtsQ  32 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0136029  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2490  cell division protein FtsQ  30.9 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2833  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.15 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000280119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>