73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1116 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1116  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  100 
 
 
295 aa  596  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00697393  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0953  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  43.2 
 
 
279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.358047 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0744  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  41.67 
 
 
278 aa  212  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0312415  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1045  cell division protein FtsQ  35.11 
 
 
278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00015927  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2604  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.42 
 
 
276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0749  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  33.33 
 
 
273 aa  116  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2198  cell division septal protein FtsQ  28.89 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000214493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  26.01 
 
 
627 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3285  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.81 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.098326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0512  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.19 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0495  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  24.43 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2784  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.61 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.397711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0666  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.26 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00317197  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  29.3 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  33.98 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3970  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.12 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.035895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  26.24 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  32.3 
 
 
312 aa  59.3  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0749  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.1 
 
 
232 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116694  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3065  cell division protein FtsQ  24.66 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  30.25 
 
 
346 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5216  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.41 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78216  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  28.14 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  33.33 
 
 
310 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2924  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.81 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000800254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.4 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2847  cell division protein FtsQ  32.32 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  31.25 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2076  cell division protein FtsQ  31.82 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000439977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4384  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.25 
 
 
289 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00442513  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.95 
 
 
329 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.25 
 
 
289 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4509  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.25 
 
 
289 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1559  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  34.72 
 
 
285 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.517575  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1340  cell division protein FtsQ  29.25 
 
 
289 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226381  normal  0.0690806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1022  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.16 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00172574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  27.91 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4099  cell division protein FtsQ  30.28 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3453  cell division septal protein-like  24.11 
 
 
347 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  28.03 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.48 
 
 
334 aa  49.7  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0337  putative cell division protein FtsQ  27.62 
 
 
271 aa  49.3  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  25.2 
 
 
330 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0679  cell division protein FtsQ  31.08 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.949656  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4405  cell division protein FtsQ, putative  28.71 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4670  cell division protein FtsQ  32.43 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000533312  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3916  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.78 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2073  cell division protein FtsQ  27.56 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.313808 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0098  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  22.66 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  26.45 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3832  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.85 
 
 
294 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3892  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.9 
 
 
277 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.880644  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57300  cell division protein FtsQ  31.08 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4981  cell division protein FtsQ  31.08 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1602  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  24.64 
 
 
256 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2449  cell division protein FtsQ  28.46 
 
 
279 aa  46.2  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0699952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4009  Polypeptide-transport-associated domain-containing protein FtsQ-type  25.62 
 
 
234 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.514475  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0585  putative cell division protein  25.15 
 
 
178 aa  46.2  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.810821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3776  cell division protein FtsQ  25.93 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  28.31 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0465  cell division protein FtsQ  28.09 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.126292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1633  cell division protein FtsQ  27.4 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.317189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0925  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.27 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316066  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2007  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.1 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69938  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0773  cell division protein FtsQ  28.68 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0728001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1893  cell division protein FtsQ  24.03 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0326  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.58 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256258  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3437  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.86 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2857  cell division protein FtsQ  24.12 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516173  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1826  cell division protein FtsQ  25.18 
 
 
248 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2425  cell division protein FtsQ, putative  25 
 
 
273 aa  43.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.228539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2112  cell division protein FtsQ  32.47 
 
 
248 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>