104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2784 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2784  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
298 aa  603  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.397711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0512  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.48 
 
 
274 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3285  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.01 
 
 
274 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.098326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0495  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.1 
 
 
274 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0666  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.2 
 
 
275 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00317197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2198  cell division septal protein FtsQ  30.54 
 
 
282 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000214493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  29.08 
 
 
627 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3970  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.68 
 
 
275 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.035895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3065  cell division protein FtsQ  31.52 
 
 
276 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3892  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.38 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.880644  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3916  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.96 
 
 
270 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5216  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.42 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78216  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3776  cell division protein FtsQ  29.91 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3832  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.44 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0744  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.58 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0312415  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0679  cell division protein FtsQ  31.12 
 
 
251 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.949656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1432  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.31 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7385  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0749  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.67 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09110  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.3 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0301119  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0953  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  37.04 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.358047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3453  cell division septal protein-like  23.84 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0847  cell division protein FtsQ  30.6 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0360907  normal  0.845904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2604  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.39 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1116  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.61 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00697393  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1045  cell division protein FtsQ  34.21 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00015927  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0749  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.58 
 
 
232 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116694  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2007  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.51 
 
 
237 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3211  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.43 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25033  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4059  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  23.12 
 
 
241 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000457431  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0098  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25 
 
 
217 aa  60.5  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  30.22 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1559  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  33.33 
 
 
285 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.517575  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3437  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.14 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12181  cell division protein ftsQ  34.44 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000903936  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1059  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  21 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2425  cell division protein FtsQ, putative  29.12 
 
 
273 aa  53.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.228539  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  27.19 
 
 
331 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4981  cell division protein FtsQ  24.63 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57300  cell division protein FtsQ  24.63 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  24.27 
 
 
340 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  29.2 
 
 
346 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1409  polypeptide-transport-associated domain-containing protein FtsQ-type  31.09 
 
 
221 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.571573  normal  0.075742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  22.76 
 
 
309 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0488  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28 
 
 
362 aa  52  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000268225  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0780  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25 
 
 
250 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0258619  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0585  putative cell division protein  32.89 
 
 
178 aa  50.8  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.810821  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  29.91 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2449  cell division protein FtsQ  31.85 
 
 
279 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0699952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2873  cell division protein FtsQ  28 
 
 
222 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  28.97 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2500  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.21 
 
 
297 aa  49.3  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2857  cell division protein FtsQ  24.3 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2112  cell division protein FtsQ  25.53 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2189  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.09 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171516  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0307  DivIB  24.83 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1202  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.22 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1826  cell division protein FtsQ  25 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0773  cell division protein FtsQ  26.92 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0728001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2092  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.55 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.995763  hitchhiker  0.0000000659531 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3515  cell division protein FtsQ  23.86 
 
 
263 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228011  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3166  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.47 
 
 
382 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2197  cell division protein FtsQ  24.27 
 
 
240 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0102896  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3384  cell division protein FtsQ  23.86 
 
 
275 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000592378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.35 
 
 
334 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2519  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  24.2 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.655608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.1 
 
 
329 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3495  cell division protein FtsQ  34.18 
 
 
246 aa  46.2  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0823778  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3667  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.3 
 
 
277 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.364111  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2977  cell division protein FtsQ  24.3 
 
 
277 aa  46.2  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00192048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4670  cell division protein FtsQ  24.39 
 
 
288 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000533312  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3414  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.17 
 
 
263 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0285361  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1893  cell division protein FtsQ  27.68 
 
 
323 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2639  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.33 
 
 
310 aa  45.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5761  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.68 
 
 
240 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.258575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  27.1 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3472  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.55 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350716  normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2990  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.9 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  0.0214492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0639  cell division protein FtsQ  22.94 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000184858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4509  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.61 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  28.04 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.61 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08880  cell division septal protein  24.43 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0014958  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4009  Polypeptide-transport-associated domain-containing protein FtsQ-type  32.29 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.514475  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1340  cell division protein FtsQ  25.61 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226381  normal  0.0690806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4405  cell division protein FtsQ, putative  31.65 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4099  cell division protein FtsQ  31.65 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0829  cell division septal protein-like protein  28.95 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0862377  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0140  cell division protein FtsQ  22.54 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467459  normal  0.392627 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09470  cell division septal protein  27.91 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000495605  normal  0.0238077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4384  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.61 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00442513  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0143  cell division protein FtsQ  22.54 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00198063  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0143  cell division protein FtsQ  22.54 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216821  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0147  cell division protein FtsQ  22.54 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183403  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0148  cell division protein FtsQ  22.54 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000728019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0899  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.93 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1076  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.57 
 
 
336 aa  44.3  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.440975  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2670  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.04 
 
 
250 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13280  Cell division protein FtsQ  24.22 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.021703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0453  cell division protein FtsQ  30.34 
 
 
271 aa  43.5  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0577053  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  19.89 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>