36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2500 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2500  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  100 
 
 
297 aa  597  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2892  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  53.85 
 
 
267 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0118033  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2718  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  45.19 
 
 
294 aa  245  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0057  FtsQ protein, putative  45.7 
 
 
291 aa  206  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00293686  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2519  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  42.44 
 
 
287 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.655608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2260  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  41.48 
 
 
286 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00197696  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2107  FtsQ protein, putative  40.32 
 
 
281 aa  186  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.23865  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2699  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.23 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3324  hypothetical protein  23.77 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200003  normal  0.682963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0847  cell division protein FtsQ  30.77 
 
 
261 aa  55.8  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0360907  normal  0.845904 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2737  cell division protein  21.78 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4754  hypothetical protein  22.22 
 
 
257 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1602  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.83 
 
 
256 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1112  cell division protein FtsQ  25.48 
 
 
244 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.962822  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2784  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.21 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.397711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0679  cell division protein FtsQ  26.89 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.949656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  24.6 
 
 
627 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2873  cell division protein FtsQ  27.54 
 
 
222 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3486  hypothetical protein  22.56 
 
 
258 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.310626  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0582  cell division protein FtsQ, putative  25.26 
 
 
258 aa  46.2  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  28.47 
 
 
303 aa  46.2  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3453  cell division septal protein-like  27.27 
 
 
347 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09110  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0301119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0666  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.11 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00317197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3472  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.03 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350716  normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1247  hypothetical protein  20.1 
 
 
253 aa  45.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  29.67 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3922  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.46 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  25.44 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4059  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  24.81 
 
 
241 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000457431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6105  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  22.7 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142366  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1059  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  23.6 
 
 
245 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0442  cell division protein FtsQ  37.78 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.462721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0453  cell division protein FtsQ  24.9 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0577053  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  27.61 
 
 
320 aa  42.7  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0744  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.57 
 
 
278 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0312415  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>