142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1284 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  100 
 
 
346 aa  674    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  84.68 
 
 
340 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  71.32 
 
 
349 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  69.03 
 
 
302 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  66.17 
 
 
330 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  57.4 
 
 
332 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  58.98 
 
 
329 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0326  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  44.15 
 
 
291 aa  232  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256258  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  41.7 
 
 
326 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  40.18 
 
 
312 aa  202  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.351672  normal  0.0843498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3174  cell division protein FtsQ  39.88 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0135629  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6699  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  41.35 
 
 
324 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  39.42 
 
 
291 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2352  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  40.31 
 
 
317 aa  199  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.439239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3131  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  39.3 
 
 
312 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7438  cell division protein FtsQ  43.82 
 
 
327 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.4 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1427  cell division protein FtsQ, putative  37.55 
 
 
288 aa  179  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1384  putative cell division protein FtsQ  37.15 
 
 
295 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37 
 
 
327 aa  176  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1748  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.63 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2076  cell division protein FtsQ  37.98 
 
 
309 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000439977 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  36.14 
 
 
309 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2847  cell division protein FtsQ  34.83 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  35.21 
 
 
310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  42.27 
 
 
331 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  33.46 
 
 
308 aa  161  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3166  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.73 
 
 
382 aa  125  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  33.69 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.5 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  33.85 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2073  cell division protein FtsQ  33.2 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.313808 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  34.89 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2752  cell division protein FtsQ  33.8 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0067  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.5 
 
 
292 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0687  cell division protein FtsQ  27.69 
 
 
299 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0983299  decreased coverage  0.000241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2418  putative cell division protein FtsQ  36.81 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000895115  normal  0.230977 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0337  putative cell division protein FtsQ  27.16 
 
 
271 aa  79  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0698  cell division protein FtsQ  25.61 
 
 
304 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0788  cell division protein FtsQ  25.34 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.290421  normal  0.28339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2112  cell division septal protein FtsQ  25.34 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4489  cell division protein FtsQ  29.27 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681161  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0096  cell division protein FtsQ, putative  27.86 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0744  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.76 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0312415  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0666  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.26 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00317197  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0669  cell division protein FtsQ  25.63 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.809619  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2087  cell division protein FtsQ  31.58 
 
 
263 aa  63.5  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.588433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2857  cell division protein FtsQ  25.42 
 
 
265 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2449  cell division protein FtsQ  27.66 
 
 
279 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0699952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3285  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.97 
 
 
274 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.098326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3776  cell division protein FtsQ  31.21 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3832  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  33.64 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0953  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.36 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.358047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1633  cell division protein FtsQ  35.19 
 
 
249 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.317189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3970  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.87 
 
 
275 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.035895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3916  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.71 
 
 
270 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1116  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.25 
 
 
295 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00697393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  28.21 
 
 
627 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0749  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.38 
 
 
273 aa  55.8  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2604  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.48 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2092  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.85 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.995763  hitchhiker  0.0000000659531 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09470  cell division septal protein  36 
 
 
285 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000495605  normal  0.0238077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0512  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.61 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13280  Cell division protein FtsQ  25.68 
 
 
286 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.021703  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0495  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.61 
 
 
274 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3453  cell division septal protein-like  24.51 
 
 
347 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3802  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.69 
 
 
256 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0128831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2189  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.08 
 
 
271 aa  53.1  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171516  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09110  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.31 
 
 
235 aa  53.1  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0301119  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2784  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.2 
 
 
298 aa  53.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.397711  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3892  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.43 
 
 
277 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.880644  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1968  cell division protein  25 
 
 
243 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00917782  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0228  cell division protein FtsQ  25 
 
 
243 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000146493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0491  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.9 
 
 
250 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00415174  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0851  chaperonin Cpn60/TCP-1  20.77 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.127237  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0488  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.25 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000268225  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0466  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.36 
 
 
250 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0206402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3809  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.59 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000142789  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0925  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.5 
 
 
288 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316066  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3648  cell division protein FtsQ  23.72 
 
 
250 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0726048  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3451  cell division protein FtsQ  25.68 
 
 
254 aa  49.3  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.188936  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08880  cell division septal protein  33.33 
 
 
277 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0014958  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2425  cell division protein FtsQ, putative  27.12 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.228539  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0080  cell division protein FtsQ  22.9 
 
 
250 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0562  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.9 
 
 
250 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000118415  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0170  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.56 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000748343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3384  cell division protein FtsQ  23.97 
 
 
275 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000592378  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2833  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.86 
 
 
250 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000280119  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0533  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.9 
 
 
250 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000284929  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2534  cell division protein FtsQ  28.57 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0899  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.92 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1602  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.41 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0749  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.41 
 
 
232 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116694  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0639  cell division protein FtsQ  26.24 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000184858  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1432  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.52 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3515  cell division protein FtsQ  23.97 
 
 
263 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228011  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2664  cell division protein FtsQ  28.57 
 
 
239 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0057  FtsQ protein, putative  29.63 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00293686  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0357  cell division protein FtsQ  29.73 
 
 
250 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205743  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2670  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.64 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>