70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0488 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0488  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  100 
 
 
362 aa  727    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000268225  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08880  cell division septal protein  33.46 
 
 
277 aa  153  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0014958  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09470  cell division septal protein  34.32 
 
 
285 aa  152  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000495605  normal  0.0238077 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2092  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.99 
 
 
325 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.995763  hitchhiker  0.0000000659531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2408  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.39 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.165705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3285  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.81 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.098326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3197  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.88 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0419816  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2198  cell division septal protein FtsQ  33.64 
 
 
282 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000214493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  29.09 
 
 
627 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12181  cell division protein ftsQ  26.42 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000903936  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3892  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.04 
 
 
277 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.880644  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0495  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.47 
 
 
274 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0512  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.47 
 
 
274 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3254  cell division protein FtsQ  27.97 
 
 
309 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3265  cell division protein FtsQ  27.97 
 
 
309 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0746859  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3316  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.97 
 
 
309 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3521  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.78 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0666  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.72 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00317197  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3776  cell division protein FtsQ  29.41 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  31.25 
 
 
349 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0847  cell division protein FtsQ  23.66 
 
 
261 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0360907  normal  0.845904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3970  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.57 
 
 
275 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.035895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2699  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.97 
 
 
273 aa  56.6  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2990  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.92 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  0.0214492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4059  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  23.72 
 
 
241 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000457431  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0749  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  24.49 
 
 
273 aa  53.5  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3832  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.49 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2784  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28 
 
 
298 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.397711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1059  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  21.05 
 
 
245 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22780  cell division septal protein  26.09 
 
 
408 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0151771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  31.25 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1893  cell division protein FtsQ  24.24 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2873  cell division protein FtsQ  25 
 
 
222 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3916  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.49 
 
 
270 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0123  cell division protein FtsQ  24.04 
 
 
258 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0118462  normal  0.0546575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4009  Polypeptide-transport-associated domain-containing protein FtsQ-type  25.76 
 
 
234 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.514475  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1202  cell division protein FtsQ, putative  28.69 
 
 
285 aa  50.4  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.130482  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  26.47 
 
 
320 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3211  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.76 
 
 
273 aa  49.7  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25033  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1268  cell division protein FtsQ  23.3 
 
 
439 aa  49.3  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0579703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1243  cell division protein FtsQ  23.3 
 
 
439 aa  49.3  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00538458  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1559  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  21.49 
 
 
285 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.517575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1572  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.02 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1022  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.21 
 
 
259 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00172574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2007  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.04 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3437  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.91 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.63 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  23.35 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2534  cell division protein FtsQ  30.23 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  28.99 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2664  cell division protein FtsQ  30.23 
 
 
239 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.99 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0899  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  23.7 
 
 
256 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  26.92 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0953  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.24 
 
 
279 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.358047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  35.59 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2449  cell division protein FtsQ  23.03 
 
 
279 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0699952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0764  cell division protein FtsQ  25 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.691336 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1306  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.91 
 
 
264 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.646956  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0679  cell division protein FtsQ  21.91 
 
 
251 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.949656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3467  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  23.4 
 
 
250 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000457508  hitchhiker  0.00184571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0824  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.93 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0098  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.09 
 
 
217 aa  43.9  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0489  putative cell division transmembrane protein, FtsQ  22.98 
 
 
250 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0227105  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1432  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28 
 
 
236 aa  43.9  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7385  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0170  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  19.51 
 
 
285 aa  43.9  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000748343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0613  cell division protein FtsQ  22.12 
 
 
284 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0180301  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3015  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.73 
 
 
232 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.320807  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2644  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.78 
 
 
233 aa  42.7  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1409  polypeptide-transport-associated domain-containing protein FtsQ-type  22.02 
 
 
221 aa  42.7  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.571573  normal  0.075742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>