58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1572 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1572  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
300 aa  593  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254268  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1573  cell division protein FtsQ  66.03 
 
 
311 aa  353  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.470936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2990  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.83 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  0.0214492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2873  cell division protein FtsQ  31.98 
 
 
222 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3521  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.38 
 
 
299 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1409  polypeptide-transport-associated domain-containing protein FtsQ-type  31.31 
 
 
221 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.571573  normal  0.075742 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1076  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.83 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.440975  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27390  cell division septal protein  31.42 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.922361  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1286  cell division protein FtsQ  31.93 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3197  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  37.86 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0419816  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12181  cell division protein ftsQ  28.51 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000903936  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13580  cell division septal protein  32.85 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.174509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3061  cell division protein FtsQ  33.99 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2408  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.09 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.165705 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1099  POTRA domain protein, FtsQ-type  25.17 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3015  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.04 
 
 
232 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.320807  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0183  cell division septal protein  27.19 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.438264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1597  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  34.12 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289205  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3261  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  37.68 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.945863  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22780  cell division septal protein  34.55 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0151771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5761  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.35 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.258575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0679  cell division protein FtsQ  26.61 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.949656  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3922  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.39 
 
 
268 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3265  cell division protein FtsQ  30.09 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0746859  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3254  cell division protein FtsQ  30.09 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3316  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.09 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0899  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.94 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2644  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.72 
 
 
233 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3437  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.98 
 
 
260 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3211  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.43 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25033  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4009  Polypeptide-transport-associated domain-containing protein FtsQ-type  29.44 
 
 
234 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.514475  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3792  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.49 
 
 
277 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00498269  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1432  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.15 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7385  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10830  cell division septal protein  28.82 
 
 
352 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.603972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0847  cell division protein FtsQ  27.83 
 
 
261 aa  56.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0360907  normal  0.845904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4059  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.21 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000457431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.08 
 
 
304 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1559  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.19 
 
 
285 aa  52.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.517575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1893  cell division protein FtsQ  26.67 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1022  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00172574  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0488  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  22.86 
 
 
362 aa  50.4  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000268225  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6105  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.88 
 
 
266 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142366  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2092  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  35.24 
 
 
325 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.995763  hitchhiker  0.0000000659531 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1059  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  21.9 
 
 
245 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09110  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  22.13 
 
 
235 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0301119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1089  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.7 
 
 
275 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  25.83 
 
 
326 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  31.34 
 
 
380 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  27.66 
 
 
320 aa  46.2  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2604  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  24.11 
 
 
276 aa  45.8  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3472  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.06 
 
 
274 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350716  normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0163  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  24.24 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000529467  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09470  cell division septal protein  24.02 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000495605  normal  0.0238077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1112  cell division protein FtsQ  29.03 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.962822  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3758  Cell division septal protein-like protein  26.09 
 
 
313 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.325614  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2007  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.06 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2924  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.73 
 
 
252 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000800254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.17 
 
 
327 aa  42.7  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>