34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3792 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3792  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  550  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00498269  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1089  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  80 
 
 		 275 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2857  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  41.57 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3505  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.52 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1602  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.26 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09110  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.36 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0301119  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1572  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.7 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254268  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2604  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.62 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1633  cell division protein FtsQ  27.13 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.317189 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0953  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.9 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.358047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0679  cell division protein FtsQ  25.12 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.949656  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0744  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.69 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0312415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1573  cell division protein FtsQ  26.63 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.470936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  28.79 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1045  cell division protein FtsQ  27.08 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00015927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0453  cell division protein FtsQ  31.11 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0577053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1022  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.37 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00172574  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2092  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.26 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.995763  hitchhiker  0.0000000659531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0749  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.83 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2198  cell division septal protein FtsQ  29.82 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000214493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0749  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.1 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3472  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.38 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350716  normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3486  hypothetical protein  24.45 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.310626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2873  cell division protein FtsQ  26.64 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  26.45 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3127  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  34.94 
 
 		 411 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2007  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.08 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  24.41 
 
 		 627 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  30.09 
 
 		 349 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  27.17 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12181  cell division protein ftsQ  26.92 
 
 		 314 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000903936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  32.97 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.61 
 
 		 304 aa  42  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>