15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3486 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3486  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  530  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.310626  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4754  hypothetical protein  39.04 
 
 
257 aa  202  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1247  hypothetical protein  34.6 
 
 
253 aa  149  4e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2737  cell division protein  28.03 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6980  hypothetical protein  31.28 
 
 
354 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0010726  hitchhiker  0.000000000893041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3324  hypothetical protein  27.63 
 
 
314 aa  118  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200003  normal  0.682963 
 
 
-
 
NC_002950  PG0582  cell division protein FtsQ, putative  27.52 
 
 
258 aa  98.6  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06510  cell division protein FtsQ  28.57 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.972067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1812  hypothetical protein  25.79 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0215  FtsQ-like cell division protein  26.18 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.545832  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2107  FtsQ protein, putative  26.73 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.23865  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  25.63 
 
 
627 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2500  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  22.56 
 
 
297 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3792  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.45 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00498269  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1059  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  22.16 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>