178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0946 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  100 
 
 
331 aa  629  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  40.48 
 
 
346 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  42.86 
 
 
334 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0326  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.56 
 
 
291 aa  159  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256258  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  41.36 
 
 
340 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  42.36 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  40.59 
 
 
349 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  41.09 
 
 
330 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2352  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  41.21 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.439239 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1748  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.44 
 
 
295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1384  putative cell division protein FtsQ  35.44 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1427  cell division protein FtsQ, putative  35.44 
 
 
288 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387977  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7438  cell division protein FtsQ  41.87 
 
 
327 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  37.91 
 
 
332 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  38.81 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6699  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.2 
 
 
324 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  34.3 
 
 
291 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  39.9 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2073  cell division protein FtsQ  37.25 
 
 
299 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.313808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3174  cell division protein FtsQ  36.33 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0135629  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  33.21 
 
 
310 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.33 
 
 
312 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.351672  normal  0.0843498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3131  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  35.94 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  33.65 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3166  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  37.05 
 
 
382 aa  126  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36 
 
 
327 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  32.37 
 
 
308 aa  122  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2847  cell division protein FtsQ  31.79 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2076  cell division protein FtsQ  31.88 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000439977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  33.18 
 
 
326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.64 
 
 
304 aa  109  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0096  cell division protein FtsQ, putative  29.8 
 
 
252 aa  109  7.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0067  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  42.7 
 
 
292 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  33.33 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0788  cell division protein FtsQ  33.14 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.290421  normal  0.28339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0698  cell division protein FtsQ  34.32 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2112  cell division septal protein FtsQ  33.14 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2752  cell division protein FtsQ  35.12 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4489  cell division protein FtsQ  28.16 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681161  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  32.56 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0687  cell division protein FtsQ  29 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0983299  decreased coverage  0.000241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2418  putative cell division protein FtsQ  27.27 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000895115  normal  0.230977 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0337  putative cell division protein FtsQ  23.94 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0669  cell division protein FtsQ  23 
 
 
275 aa  67  0.0000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.809619  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0744  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.84 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0312415  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0899  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  39.42 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0749  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.18 
 
 
232 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116694  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0057  FtsQ protein, putative  34.07 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00293686  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0140  cell division protein FtsQ  26.57 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467459  normal  0.392627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3892  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.23 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.880644  normal  0.345265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3495  cell division protein FtsQ  27.96 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0823778  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1112  cell division protein FtsQ  40.45 
 
 
244 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.962822  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0143  cell division protein FtsQ  26.57 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216821  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0143  cell division protein FtsQ  26.57 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00198063  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0148  cell division protein FtsQ  26.57 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000728019  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0147  cell division protein FtsQ  26.57 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183403  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1045  cell division protein FtsQ  31.01 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00015927  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0847  cell division protein FtsQ  36.04 
 
 
261 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0360907  normal  0.845904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3015  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  38.36 
 
 
232 aa  56.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.320807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0764  cell division protein FtsQ  24.62 
 
 
283 aa  56.2  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000031953  normal  0.691336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3414  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.15 
 
 
263 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0285361  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4462  cell division protein FtsQ  32.5 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1059  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.36 
 
 
245 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0749  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.4 
 
 
273 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1559  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.63 
 
 
285 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.517575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3384  cell division protein FtsQ  26.13 
 
 
275 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000592378  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2784  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.19 
 
 
298 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.397711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3515  cell division protein FtsQ  26.13 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0639  cell division protein FtsQ  24.63 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000184858  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3922  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.31 
 
 
268 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0851  chaperonin Cpn60/TCP-1  23.67 
 
 
285 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.127237  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0651  cell division protein FtsQ  30.91 
 
 
284 aa  53.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0684604  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004488  cell division protein FtsQ  24.62 
 
 
260 aa  53.1  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00754349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3667  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.27 
 
 
277 aa  53.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.364111  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2977  cell division protein FtsQ  29.27 
 
 
277 aa  53.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00192048  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2892  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.67 
 
 
267 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0118033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3472  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.19 
 
 
274 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350716  normal  0.0407189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00094  membrane anchored protein involved in growth of wall at septum  26.21 
 
 
276 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0098  cell division protein FtsQ  26.21 
 
 
276 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000317726  normal  0.746071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0101  cell division protein FtsQ  26.21 
 
 
276 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00093  hypothetical protein  26.21 
 
 
276 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.015321  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0086  cell division protein FtsQ  26.21 
 
 
276 aa  52.8  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000154826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3516  cell division protein FtsQ  26.88 
 
 
253 aa  52.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.320398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4531  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29 
 
 
218 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0127742  hitchhiker  0.000127547 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0099  cell division protein FtsQ  26.21 
 
 
276 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0095  cell division protein FtsQ  26.21 
 
 
276 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000354285  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3507  cell division protein FtsQ  26.21 
 
 
276 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000541372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1409  polypeptide-transport-associated domain-containing protein FtsQ-type  32.88 
 
 
221 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.571573  normal  0.075742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3564  cell division protein FtsQ  26.21 
 
 
276 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0148979  normal  0.0119614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2007  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.73 
 
 
237 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00904  hypothetical protein  29 
 
 
260 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0123  cell division protein FtsQ  32.89 
 
 
258 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0118462  normal  0.0546575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2857  cell division protein FtsQ  33.33 
 
 
265 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516173  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2490  cell division protein FtsQ  29.82 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1078  cell division protein FtsQ  28.11 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0136029  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0666  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.24 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00317197  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0202  cell division protein FtsQ  29.44 
 
 
280 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2604  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.06 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0381  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.44 
 
 
280 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00296108  normal  0.100496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12181  cell division protein ftsQ  32.61 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000903936  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>