155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2076 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2076  cell division protein FtsQ  100 
 
 		 309 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000439977 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  64.52 
 
 		 310 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2847  cell division protein FtsQ  64.19 
 
 		 310 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  64.21 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1748  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  51.93 
 
 		 295 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1427  cell division protein FtsQ, putative  50.52 
 
 		 288 aa  289  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1384  putative cell division protein FtsQ  50.17 
 
 		 295 aa  288  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  47.48 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  37.18 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0326  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.58 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256258  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  38.25 
 
 		 349 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  40.73 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  37.21 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  37.98 
 
 		 346 aa  172  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  39.2 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  37.2 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  35.11 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  37.2 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6699  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.14 
 
 		 324 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2352  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.66 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.439239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  33.9 
 
 		 326 aa  139  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7438  cell division protein FtsQ  36.1 
 
 		 327 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3174  cell division protein FtsQ  34.69 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0135629  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3131  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  33.71 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.69 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.351672  normal  0.0843498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.2 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3166  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  38.05 
 
 		 382 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  31.88 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  32.09 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2073  cell division protein FtsQ  31.86 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.313808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0687  cell division protein FtsQ  30.2 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0983299  decreased coverage  0.000241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2418  putative cell division protein FtsQ  30.85 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000895115  normal  0.230977 
 
 
-
 
NC_002978  WD0096  cell division protein FtsQ, putative  28 
 
 		 252 aa  87  4e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0067  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.5 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  28.7 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.32 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0749  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.64 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4489  cell division protein FtsQ  26.5 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2752  cell division protein FtsQ  30.2 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.417111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0698  cell division protein FtsQ  27.43 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  25.1 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0788  cell division protein FtsQ  24.79 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.290421  normal  0.28339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2112  cell division septal protein FtsQ  24.79 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0749  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.29 
 
 		 273 aa  67  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0744  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.34 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0312415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2087  cell division protein FtsQ  29.41 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.588433  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0953  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.57 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.358047 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0337  putative cell division protein FtsQ  22.56 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0184  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.21 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000203448  normal  0.635947 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3802  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.68 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0128831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3453  cell division septal protein-like  31.43 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1045  cell division protein FtsQ  28.3 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00015927  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1121  cell division protein FtsQ  27.33 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04364  cell division protein FtsQ  28.71 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.749304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3451  cell division protein FtsQ  25.93 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.188936  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3467  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.93 
 
 		 250 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000457508  hitchhiker  0.00184571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2873  cell division protein FtsQ  33.33 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2548  cell division protein FtsQ  26.71 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3541  cell division protein FtsQ  26.71 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0489  putative cell division transmembrane protein, FtsQ  24.26 
 
 		 250 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0227105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0469  cell division protein FtsQ  26.71 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1328  cell division protein FtsQ  26.71 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64132  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3522  cell division protein FtsQ  26.71 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3547  cell division protein FtsQ  26.71 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3235  cell division protein FtsQ  26.71 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0170  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.62 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000748343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0533  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.88 
 
 		 250 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000284929  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3648  cell division protein FtsQ  23.88 
 
 		 250 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0726048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0357  cell division protein FtsQ  27.16 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0080  cell division protein FtsQ  23.88 
 
 		 250 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0562  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.88 
 
 		 250 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000118415  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2670  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.47 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2604  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  27.27 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1116  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.82 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00697393  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2265  cell division protein FtsQ  25.51 
 
 		 243 aa  53.1  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.245819  hitchhiker  0.00532421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3424  cell division protein FtsQ  25.46 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.291979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3285  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.098326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0491  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.38 
 
 		 250 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00415174  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0466  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.38 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0206402  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2490  cell division protein FtsQ  26.38 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0605  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25.81 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2833  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.32 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000280119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0669  cell division protein FtsQ  21.3 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.809619  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0356  cell division protein FtsQ  22.71 
 
 		 274 aa  50.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  hitchhiker  0.000649691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0465  cell division protein FtsQ  23.23 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2449  cell division protein FtsQ  26.59 
 
 		 279 aa  49.7  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0699952  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004488  cell division protein FtsQ  23.98 
 
 		 260 aa  49.3  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00754349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2642  cell division protein FtsQ  23.16 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0415  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.56 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235658  hitchhiker  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0429  cell division protein FtsQ  25.11 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000800756  hitchhiker  0.0000000000534186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0899  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.5 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0525  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.981478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3516  cell division protein FtsQ  25.25 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.320398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0666  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  25 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00317197  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3414  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.67 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0285361  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4573  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.88 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0515888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3970  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.38 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.035895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2197  cell division protein FtsQ  24.55 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0102896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3809  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.55 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000142789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4531  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.73 
 
 		 218 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0127742  hitchhiker  0.000127547 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>