45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4489 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_4489  cell division protein FtsQ  100 
 
 
340 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681161  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2112  cell division septal protein FtsQ  49.83 
 
 
308 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0788  cell division protein FtsQ  49.5 
 
 
308 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.290421  normal  0.28339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0698  cell division protein FtsQ  49.28 
 
 
304 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2418  putative cell division protein FtsQ  45.85 
 
 
297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000895115  normal  0.230977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0687  cell division protein FtsQ  47.17 
 
 
299 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0983299  decreased coverage  0.000241 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2752  cell division protein FtsQ  42.24 
 
 
311 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1384  putative cell division protein FtsQ  30.91 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1427  cell division protein FtsQ, putative  30.91 
 
 
288 aa  92.8  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.49 
 
 
334 aa  92.8  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1748  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.66 
 
 
295 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  26.89 
 
 
291 aa  89.4  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2352  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.63 
 
 
317 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.439239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3174  cell division protein FtsQ  32.56 
 
 
312 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0135629  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.56 
 
 
312 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.351672  normal  0.0843498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3131  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  32.09 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  28.16 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  29.5 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7438  cell division protein FtsQ  36.36 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  28.86 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.79 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2076  cell division protein FtsQ  26.5 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000439977 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  27.23 
 
 
310 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.17 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2847  cell division protein FtsQ  27.23 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  29.27 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  30.61 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3166  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.77 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6699  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.64 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  29.11 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0326  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.6 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256258  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  27.8 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  23.73 
 
 
326 aa  63.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  26.34 
 
 
329 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2073  cell division protein FtsQ  28.57 
 
 
299 aa  59.3  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.313808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  29.33 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  35.64 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  26.34 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_002978  WD0096  cell division protein FtsQ, putative  22.7 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  26.7 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  23.55 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0337  putative cell division protein FtsQ  27.16 
 
 
271 aa  52.8  0.000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0669  cell division protein FtsQ  26.13 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.809619  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004488  cell division protein FtsQ  28.31 
 
 
260 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00754349  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0067  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.5 
 
 
292 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>