50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2418 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2418  putative cell division protein FtsQ  100 
 
 		 297 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000895115  normal  0.230977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0687  cell division protein FtsQ  46.5 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0983299  decreased coverage  0.000241 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4489  cell division protein FtsQ  45.85 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2752  cell division protein FtsQ  45.45 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.417111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0788  cell division protein FtsQ  43.19 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.290421  normal  0.28339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2112  cell division septal protein FtsQ  43.82 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0698  cell division protein FtsQ  42.7 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  34.58 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  34.33 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1427  cell division protein FtsQ, putative  32.18 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1384  putative cell division protein FtsQ  32.18 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.53 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.14 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1748  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.68 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  33.63 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  31.98 
 
 		 332 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.99 
 
 		 334 aa  92.4  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  30.18 
 
 		 340 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  39.58 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2076  cell division protein FtsQ  30.85 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000439977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2847  cell division protein FtsQ  29.74 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  30.65 
 
 		 349 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  28.79 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  36.81 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  26.53 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3174  cell division protein FtsQ  29.86 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0135629  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0326  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.57 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256258  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.5 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.351672  normal  0.0843498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3131  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.82 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3166  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  31.6 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2352  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.46 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.439239 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  33.82 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7438  cell division protein FtsQ  36.14 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  27.27 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6699  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.87 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.79 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  28.79 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  27.14 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  30.2 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_002978  WD0096  cell division protein FtsQ, putative  25 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2073  cell division protein FtsQ  25.26 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.313808 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0337  putative cell division protein FtsQ  25.19 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0067  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.19 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2857  cell division protein FtsQ  25.99 
 
 		 265 aa  45.8  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516173  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0143  cell division protein FtsQ  24.61 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216821  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0148  cell division protein FtsQ  24.61 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000728019  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0147  cell division protein FtsQ  24.61 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0183403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0143  cell division protein FtsQ  24.61 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00198063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0140  cell division protein FtsQ  24.61 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467459  normal  0.392627 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0639  cell division protein FtsQ  24.86 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000184858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>