100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01893 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3993  insertion element IS2 transposase InsD  99.86 
 
 		 906 bp  1366    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1246  IS2 transposase orfB  99.42 
 
 		 906 bp  1342    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0408057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1121  insertion element IS2 transposase InsD  99.86 
 
 		 906 bp  1366    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3900  insertion element IS2 transposase InsD  99.57 
 
 		 906 bp  1350    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0990  insertion element IS2 transposase InsD  99.86 
 
 		 906 bp  1366    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0920  insertion element IS2 transposase InsD  99.86 
 
 		 906 bp  1366    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0901  insertion element IS2 transposase InsD  99.86 
 
 		 906 bp  1366    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0859  insertion element IS2 transposase InsD  99.42 
 
 		 906 bp  1342    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0704  IS2 transposase orfB  99.71 
 
 		 906 bp  1358    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1321  IS2 transposase orfB  99.42 
 
 		 906 bp  1342    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0515    100 
 
 		 423 bp  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0387    99.57 
 
 		 1229 bp  1350    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0290  IS2 transposase orfB  99.71 
 
 		 906 bp  1358    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0249  insertion element IS2 transposase InsD  99.86 
 
 		 906 bp  1366    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0013  insertion element IS2 transposase InsD  99.71 
 
 		 906 bp  1358    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4027  IS2 transposase orfB  99.42 
 
 		 906 bp  1342    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3165  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 906 bp  1374    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2145  insertion element IS2 transposase InsD  99.71 
 
 		 906 bp  1358    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3631  IS2 transposase orfB  99.84 
 
 		 621 bp  1223    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3732  IS2 transposase orfB  99.57 
 
 		 906 bp  1350    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3274  insertion element IS2 transposase InsD  99.86 
 
 		 906 bp  1366    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3225  IS2 transposase orfB  99.57 
 
 		 906 bp  1350    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2959  IS2 transposase orfB  99.71 
 
 		 906 bp  1358    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2946  IS2 transposase orfB  99.57 
 
 		 906 bp  1350    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2613  insertion element IS2 transposase InsD  99.42 
 
 		 906 bp  1342    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2596  insertion element IS2 transposase InsD  99.86 
 
 		 906 bp  1366    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3225    96.91 
 
 		 525 bp  898    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2131  IS2 transposase orfB  99.71 
 
 		 906 bp  1358    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1950  insertion element IS2 transposase InsD  99.86 
 
 		 906 bp  1366    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1906  IS2 transposase orfB  99.57 
 
 		 906 bp  1350    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1767  IS2 transposase orfB  99.42 
 
 		 906 bp  1342    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1732  IS2 transposase orfB  99.28 
 
 		 906 bp  1334    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1670  IS2 transposase orfB  99.28 
 
 		 906 bp  1334    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1567  insertion element IS2 transposase InsD  99.86 
 
 		 906 bp  1366    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0002  IS2 transposase orfB  99.57 
 
 		 906 bp  1350    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4144  insertion element IS2 transposase InsD  99.71 
 
 		 906 bp  1358    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4301  insertion element IS2 transposase InsD  99.71 
 
 		 906 bp  1358    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1561  insertion element IS2 transposase InsD  99.57 
 
 		 906 bp  1350    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  96.1 
 
 		 906 bp  1160    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4589  insertion element IS2 transposase InsD  99.57 
 
 		 906 bp  1350    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4646  insertion element IS2 transposase InsD  99.86 
 
 		 906 bp  1366    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4760  insertion element IS2 transposase InsD  99.86 
 
 		 906 bp  1366    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4872  insertion element IS2 transposase InsD  99.86 
 
 		 906 bp  1366    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  94.99 
 
 		 912 bp  1110    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0011  IS2 transposase orfB  99.57 
 
 		 906 bp  1350    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0073  IS2 transposase orfB  99.28 
 
 		 906 bp  1334    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2065  Integrase catalytic region  100 
 
 		 657 bp  1302    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0456907  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0237  IS2 transposase orfB  99.57 
 
 		 906 bp  1350    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.940126  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3725  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  1374    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3245  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  1374    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2243  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  1374    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.578947  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0086  IS2, transposase orfB, truncation  94.86 
 
 		 672 bp  952    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0106176  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0034  insertion element IS2 transposase InsD  99.86 
 
 		 906 bp  1366    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4090    100 
 
 		 423 bp  833    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.922194  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  94.99 
 
 		 912 bp  1110    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0394  insertion element IS2 transposase InsD  100 
 
 		 906 bp  1374    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  96.1 
 
 		 906 bp  1160    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  96.1 
 
 		 906 bp  1160    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  96.1 
 
 		 906 bp  1160    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  96.1 
 
 		 906 bp  1160    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1661  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  1374    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0830  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  1374    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0655  Integrase catalytic region  100 
 
 		 906 bp  1374    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01893    100 
 
 		 693 bp  1374    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  96.1 
 
 		 906 bp  1160    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691773 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01904  IS2 insertion element transposase InsAB'  100 
 
 		 657 bp  1302    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4356  transposase InsD for insertion element IS2A/D/F/H/I/K  99.68 
 
 		 552 bp  611  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3226    95.91 
 
 		 582 bp  603  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1920  IS2 ORF2  100 
 
 		 267 bp  504  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3118  IS2 transposase orfB  97.16 
 
 		 444 bp  496  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301889 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4787    96.96 
 
 		 480 bp  458  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4353  insertion sequence 2 OrfB protein  100 
 
 		 198 bp  392  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4089    98.84 
 
 		 387 bp  327  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.912238  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01906  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 300 bp  305  9e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0516    98.94 
 
 		 369 bp  178  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3629  IS2 transposase  100 
 
 		 315 bp  149  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6582  transposase  85.71 
 
 		 675 bp  83.8  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0096  transposase  85.71 
 
 		 888 bp  83.8  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2744  transposase  85.71 
 
 		 888 bp  83.8  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2584  transposase  85.71 
 
 		 888 bp  83.8  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1536  transposase  85.71 
 
 		 888 bp  83.8  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1453  transposase  85.71 
 
 		 888 bp  83.8  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0366  transposase  85.71 
 
 		 888 bp  83.8  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03478    86.08 
 
 		 366 bp  69.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.379725  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03528    86.08 
 
 		 393 bp  69.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4722    86.08 
 
 		 882 bp  69.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0567  ISRSO10-transposase ORFB protein  90 
 
 		 849 bp  60  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0007  IS2, transposase orfB, truncation  96.97 
 
 		 252 bp  58  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1792  integrase catalytic region  84.93 
 
 		 846 bp  58  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540172 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0027    86.67 
 
 		 120 bp  56  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  100 
 
 		 1416 bp  52  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0460  ISRSO10-transposase ORFB protein  82.56 
 
 		 603 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2331  ISRSO10-transposase ORFB protein  82.56 
 
 		 888 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1830  ISRSO10-transposase ORFB protein  82.56 
 
 		 849 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.189696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1435  ISRSO10-transposase ORFB protein  82.56 
 
 		 603 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927886  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  100 
 
 		 1197 bp  52  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  100 
 
 		 840 bp  52  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1120  IS1 transposase  100 
 
 		 351 bp  52  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0717  transposase  96.55 
 
 		 708 bp  50.1  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0305  IS2 ORF2  82.89 
 
 		 366 bp  48.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.726733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>