84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0007 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  98.78 
 
 		 301 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  98.78 
 
 		 301 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  98.78 
 
 		 301 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  98.78 
 
 		 301 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  98.78 
 
 		 301 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  98.78 
 
 		 301 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  97.56 
 
 		 303 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0007  IS2, transposase orfB, truncation  100 
 
 		 83 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  97.56 
 
 		 303 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1767  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4027  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1732  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2131  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1670  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1567  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1321  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1246  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0408057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1121  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0990  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1906  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0920  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0901  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1950  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0859  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3993  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0237  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.940126  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0073  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629539  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0011  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0002  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4872  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4760  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4646  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4589  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4301  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4144  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0830  Integrase catalytic region  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3900  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3732  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3274  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3225  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2959  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2946  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2613  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2596  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2145  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0290  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0249  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0013  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0704  IS2 transposase orfB  96.34 
 
 		 301 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0655  Integrase catalytic region  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1661  Integrase catalytic region  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2243  Integrase catalytic region  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.578947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3245  Integrase catalytic region  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3725  Integrase catalytic region  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0394  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0034  insertion element IS2 transposase InsD  96.34 
 
 		 301 aa  159  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3165  IS2 transposase orfB  95.12 
 
 		 301 aa  159  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1561  insertion element IS2 transposase InsD  95.12 
 
 		 301 aa  158  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4356  transposase InsD for insertion element IS2A/D/F/H/I/K  96.34 
 
 		 183 aa  157  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3629  IS2 transposase  95.12 
 
 		 104 aa  154  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0096  transposase  50 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2744  transposase  50 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2584  transposase  50 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1536  transposase  50 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1453  transposase  50 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0366  transposase  50 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2331  ISRSO10-transposase ORFB protein  45 
 
 		 295 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2556  integrase catalytic subunit  48.53 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1993  integrase catalytic subunit  48.53 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.140355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1930  transposase  45.57 
 
 		 297 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2605  Integrase catalytic region  63.64 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.238238 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6582  transposase  47.69 
 
 		 224 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1792  integrase catalytic region  46.67 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540172 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4856  integrase catalytic subunit  46.27 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3310  integrase catalytic subunit  46.27 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5055  integrase catalytic region  46.27 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5094  integrase catalytic region  46.27 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5564  integrase catalytic region  46.27 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923042  normal  0.135572 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6833  integrase catalytic subunit  46.27 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1830  ISRSO10-transposase ORFB protein  43.28 
 
 		 282 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.189696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4251  integrase catalytic region  39.74 
 
 		 300 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564242 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0567  ISRSO10-transposase ORFB protein  45.16 
 
 		 282 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4393  integrase catalytic subunit  40.32 
 
 		 277 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4141  hypothetical protein  40.32 
 
 		 277 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>