96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3629 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3629  IS2 transposase  100 
 
 		 104 aa  207  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4027  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1767  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0290  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0920  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3900  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0034  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3732  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3274  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0655  Integrase catalytic region  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2959  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2946  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0013  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0249  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0704  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0859  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0901  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0394  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0990  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1121  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1246  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0408057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1321  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1567  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1670  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1732  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1906  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1950  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2131  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2145  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2596  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2613  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3993  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4760  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4872  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0002  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0011  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0073  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629539  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0237  IS2 transposase orfB  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.940126  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3725  Integrase catalytic region  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4646  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4589  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3245  Integrase catalytic region  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4301  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2243  Integrase catalytic region  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.578947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1661  Integrase catalytic region  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0830  Integrase catalytic region  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4144  insertion element IS2 transposase InsD  95.15 
 
 		 301 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3165  IS2 transposase orfB  94.17 
 
 		 301 aa  193  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4356  transposase InsD for insertion element IS2A/D/F/H/I/K  95.15 
 
 		 183 aa  192  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1561  insertion element IS2 transposase InsD  94.17 
 
 		 301 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  93.2 
 
 		 301 aa  191  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  93.2 
 
 		 301 aa  191  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  93.2 
 
 		 301 aa  191  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  93.2 
 
 		 301 aa  191  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  93.2 
 
 		 301 aa  191  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3225  IS2 transposase orfB  93.2 
 
 		 301 aa  191  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  93.2 
 
 		 301 aa  191  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  92.23 
 
 		 303 aa  189  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  92.23 
 
 		 303 aa  189  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0007  IS2, transposase orfB, truncation  95.12 
 
 		 83 aa  154  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0366  transposase  50 
 
 		 295 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0096  transposase  50 
 
 		 295 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1453  transposase  50 
 
 		 295 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1536  transposase  50 
 
 		 295 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2584  transposase  50 
 
 		 295 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2744  transposase  50 
 
 		 295 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1930  transposase  50.53 
 
 		 297 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2331  ISRSO10-transposase ORFB protein  48.96 
 
 		 295 aa  90.1  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2605  Integrase catalytic region  66.1 
 
 		 273 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.238238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1993  integrase catalytic subunit  50.6 
 
 		 278 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.140355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2556  integrase catalytic subunit  50.6 
 
 		 278 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1792  integrase catalytic region  48.75 
 
 		 281 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5055  integrase catalytic region  50.6 
 
 		 278 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5564  integrase catalytic region  50.6 
 
 		 278 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923042  normal  0.135572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4856  integrase catalytic subunit  50.6 
 
 		 243 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3310  integrase catalytic subunit  50.6 
 
 		 243 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6833  integrase catalytic subunit  50.6 
 
 		 278 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5094  integrase catalytic region  50.6 
 
 		 278 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4251  integrase catalytic region  42.71 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564242 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6582  transposase  48.19 
 
 		 224 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1830  ISRSO10-transposase ORFB protein  46.99 
 
 		 282 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.189696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0567  ISRSO10-transposase ORFB protein  46.25 
 
 		 282 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6515  hypothetical protein  49.15 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0568004 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4643  integrase catalytic region  43.18 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623025  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4141  hypothetical protein  42.05 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4393  integrase catalytic subunit  42.05 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0740  integrase catalytic subunit  46.67 
 
 		 277 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2174  integrase catalytic subunit  47.54 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2024  integrase catalytic subunit  47.54 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0168  integrase catalytic subunit  47.54 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0055  integrase catalytic subunit  47.54 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000315593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2405  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 281 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6414  integrase catalytic region  43.4 
 
 		 273 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1519  Integrase catalytic region  32.98 
 
 		 271 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0717  transposase  64.29 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0317  hypothetical protein  32.18 
 
 		 141 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>