More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0055 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0055  integrase catalytic subunit  100 
 
 
282 aa  593  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000315593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0168  integrase catalytic subunit  100 
 
 
282 aa  593  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2024  integrase catalytic subunit  99.65 
 
 
282 aa  590  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2174  integrase catalytic subunit  100 
 
 
282 aa  593  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2405  integrase catalytic subunit  98.58 
 
 
281 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3181  integrase catalytic subunit  62.59 
 
 
271 aa  351  8.999999999999999e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4643  integrase catalytic region  56 
 
 
275 aa  321  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623025  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4393  integrase catalytic subunit  55.2 
 
 
277 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4141  hypothetical protein  55.2 
 
 
277 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0740  integrase catalytic subunit  55.56 
 
 
277 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6414  integrase catalytic region  56.46 
 
 
273 aa  308  9e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1792  integrase catalytic region  51.64 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.540172 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6833  integrase catalytic subunit  49.64 
 
 
278 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5564  integrase catalytic region  49.64 
 
 
278 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923042  normal  0.135572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5055  integrase catalytic region  49.64 
 
 
278 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5094  integrase catalytic region  49.64 
 
 
278 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1930  transposase  49.28 
 
 
297 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1830  ISRSO10-transposase ORFB protein  50.36 
 
 
282 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.189696  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2331  ISRSO10-transposase ORFB protein  50 
 
 
295 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  53.04 
 
 
301 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1993  integrase catalytic subunit  50 
 
 
278 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.140355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2556  integrase catalytic subunit  50 
 
 
278 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369957 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  53.04 
 
 
301 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  53.04 
 
 
301 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  53.04 
 
 
301 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  53.04 
 
 
301 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  53.04 
 
 
301 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0567  ISRSO10-transposase ORFB protein  49.27 
 
 
282 aa  251  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0096  transposase  49.09 
 
 
295 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0366  transposase  49.09 
 
 
295 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1453  transposase  49.09 
 
 
295 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1536  transposase  49.09 
 
 
295 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2584  transposase  49.09 
 
 
295 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2744  transposase  49.09 
 
 
295 aa  251  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0655  Integrase catalytic region  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0830  Integrase catalytic region  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1661  Integrase catalytic region  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2243  Integrase catalytic region  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.578947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3245  Integrase catalytic region  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3725  Integrase catalytic region  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4301  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4144  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3274  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2596  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3993  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4760  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1950  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1121  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4646  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1567  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3165  IS2 transposase orfB  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4872  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  52.61 
 
 
303 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0013  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0249  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2145  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0859  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0901  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3900  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4589  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0920  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119878  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0034  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0394  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  52.61 
 
 
303 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2613  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0990  insertion element IS2 transposase InsD  52.23 
 
 
301 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1561  insertion element IS2 transposase InsD  52.63 
 
 
301 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0290  IS2 transposase orfB  52.23 
 
 
301 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1246  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0408057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1321  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0704  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3225  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4251  integrase catalytic region  49.82 
 
 
300 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2131  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0073  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629539  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0237  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.940126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1670  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1906  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1732  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2946  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2959  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3732  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0011  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0002  IS2 transposase orfB  51.82 
 
 
301 aa  247  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1767  IS2 transposase orfB  51.42 
 
 
301 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4027  IS2 transposase orfB  51.42 
 
 
301 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2605  Integrase catalytic region  49.81 
 
 
273 aa  244  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.238238 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6515  hypothetical protein  55.14 
 
 
351 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0568004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01904  IS2 insertion element transposase InsAB'  54.63 
 
 
218 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2065  Integrase catalytic region  54.63 
 
 
218 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0456907  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4856  integrase catalytic subunit  49.18 
 
 
243 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3310  integrase catalytic subunit  49.18 
 
 
243 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1435  ISRSO10-transposase ORFB protein  56.25 
 
 
200 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927886  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0460  ISRSO10-transposase ORFB protein  56.25 
 
 
200 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112224  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3631  IS2 transposase orfB  53.09 
 
 
206 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0086  IS2, transposase orfB, truncation  53.12 
 
 
223 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0106176  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6582  transposase  43.05 
 
 
224 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191311  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0717  transposase  46.75 
 
 
235 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1297  hypothetical protein  94.37 
 
 
103 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4356  transposase InsD for insertion element IS2A/D/F/H/I/K  51.13 
 
 
183 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>