70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0027 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0027    100 
 
 		 120 bp  238  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0387    86.57 
 
 		 1229 bp  61.9  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2613  insertion element IS2 transposase InsD  86.57 
 
 		 906 bp  61.9  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0859  insertion element IS2 transposase InsD  86.57 
 
 		 906 bp  61.9  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4589  insertion element IS2 transposase InsD  86.57 
 
 		 906 bp  61.9  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3631  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 621 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3900  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3274  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3225  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2959  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2946  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2596  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2145  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2131  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1950  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1920  IS2 ORF2  86.67 
 
 		 267 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1906  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1767  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1732  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4646  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01893    86.67 
 
 		 693 bp  56  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1561  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135849 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0237  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.940126  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0073  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629539  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0011  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0002  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4872  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4760  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3732  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4353  insertion sequence 2 OrfB protein  86.67 
 
 		 198 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4301  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4144  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4090    86.67 
 
 		 423 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.922194  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4027  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3993  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1567  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01904  IS2 insertion element transposase InsAB'  86.67 
 
 		 657 bp  56  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0655  Integrase catalytic region  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0830  Integrase catalytic region  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1661  Integrase catalytic region  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2065  Integrase catalytic region  86.67 
 
 		 657 bp  56  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0456907  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2243  Integrase catalytic region  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.578947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3245  Integrase catalytic region  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3725  Integrase catalytic region  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0034  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0394  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3165  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0013  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1670  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0290  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1321  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1246  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0408057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1121  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0990  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0920  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0901  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0515    86.67 
 
 		 423 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0249  insertion element IS2 transposase InsD  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0704  IS2 transposase orfB  86.67 
 
 		 906 bp  56  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  85 
 
 		 912 bp  48.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  85 
 
 		 912 bp  48.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  85 
 
 		 906 bp  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  85 
 
 		 906 bp  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  85 
 
 		 906 bp  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  85 
 
 		 906 bp  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  85 
 
 		 906 bp  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  85 
 
 		 906 bp  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0086  IS2, transposase orfB, truncation  89.74 
 
 		 672 bp  46.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0106176  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3118  IS2 transposase orfB  89.74 
 
 		 444 bp  46.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301889 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3225    89.74 
 
 		 525 bp  46.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>