96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3225 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0901  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1670  IS2 transposase orfB  96.32 
 
 		 906 bp  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1567  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1321  IS2 transposase orfB  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1246  IS2 transposase orfB  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0408057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1121  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4144  insertion element IS2 transposase InsD  96.52 
 
 		 906 bp  882    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0990  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0920  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1732  IS2 transposase orfB  96.32 
 
 		 906 bp  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0859  insertion element IS2 transposase InsD  96.52 
 
 		 906 bp  882    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0704  IS2 transposase orfB  96.52 
 
 		 906 bp  882    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0515    97.38 
 
 		 423 bp  745    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0387    96.32 
 
 		 1229 bp  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0290  IS2 transposase orfB  96.52 
 
 		 906 bp  882    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0249  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0013  insertion element IS2 transposase InsD  96.52 
 
 		 906 bp  882    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4301  insertion element IS2 transposase InsD  96.52 
 
 		 906 bp  882    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2959  IS2 transposase orfB  96.52 
 
 		 906 bp  882    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4090    97.38 
 
 		 423 bp  745    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.922194  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4027  IS2 transposase orfB  96.32 
 
 		 906 bp  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3993  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3900  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3732  IS2 transposase orfB  96.32 
 
 		 906 bp  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3631  IS2 transposase orfB  96.71 
 
 		 621 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3274  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3225  IS2 transposase orfB  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01904  IS2 insertion element transposase InsAB'  96.91 
 
 		 657 bp  898    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2946  IS2 transposase orfB  96.32 
 
 		 906 bp  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2613  insertion element IS2 transposase InsD  96.52 
 
 		 906 bp  882    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2596  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2145  insertion element IS2 transposase InsD  96.52 
 
 		 906 bp  882    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2131  IS2 transposase orfB  96.52 
 
 		 906 bp  882    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1950  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1906  IS2 transposase orfB  96.32 
 
 		 906 bp  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1767  IS2 transposase orfB  96.32 
 
 		 906 bp  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0086  IS2, transposase orfB, truncation  97.05 
 
 		 672 bp  888    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0106176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3245  Integrase catalytic region  96.91 
 
 		 906 bp  898    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3725  Integrase catalytic region  96.91 
 
 		 906 bp  898    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1561  insertion element IS2 transposase InsD  96.52 
 
 		 906 bp  882    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135849 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2243  Integrase catalytic region  96.91 
 
 		 906 bp  898    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.578947  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0237  IS2 transposase orfB  96.32 
 
 		 906 bp  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.940126  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0073  IS2 transposase orfB  96.32 
 
 		 906 bp  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2065  Integrase catalytic region  96.91 
 
 		 657 bp  898    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0456907  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0011  IS2 transposase orfB  96.32 
 
 		 906 bp  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0002  IS2 transposase orfB  96.32 
 
 		 906 bp  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4872  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4760  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4646  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4589  insertion element IS2 transposase InsD  96.32 
 
 		 906 bp  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01893    96.91 
 
 		 693 bp  898    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  96.85 
 
 		 912 bp  880    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0034  insertion element IS2 transposase InsD  96.71 
 
 		 906 bp  890    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0655  Integrase catalytic region  96.91 
 
 		 906 bp  898    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0830  Integrase catalytic region  96.91 
 
 		 906 bp  898    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3225    100 
 
 		 525 bp  1041    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3165  IS2 transposase orfB  96.91 
 
 		 906 bp  898    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  97.49 
 
 		 906 bp  922    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  97.49 
 
 		 906 bp  922    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  97.49 
 
 		 906 bp  922    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1661  Integrase catalytic region  96.91 
 
 		 906 bp  898    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  97.49 
 
 		 906 bp  922    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  97.49 
 
 		 906 bp  922    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  97.49 
 
 		 906 bp  922    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0394  insertion element IS2 transposase InsD  96.91 
 
 		 906 bp  898    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  96.85 
 
 		 912 bp  880    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3118  IS2 transposase orfB  96.45 
 
 		 444 bp  480  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1920  IS2 ORF2  97.64 
 
 		 267 bp  456  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4787    95.42 
 
 		 480 bp  444  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53238 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3226    100 
 
 		 582 bp  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4353  insertion sequence 2 OrfB protein  97.47 
 
 		 198 bp  353  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4356  transposase InsD for insertion element IS2A/D/F/H/I/K  94.12 
 
 		 552 bp  206  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0516    96.49 
 
 		 369 bp  97.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0567  ISRSO10-transposase ORFB protein  92 
 
 		 849 bp  67.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4722    87.69 
 
 		 882 bp  65.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03478    87.69 
 
 		 366 bp  65.9  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.379725  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03528    87.69 
 
 		 393 bp  65.9  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1792  integrase catalytic region  86.3 
 
 		 846 bp  65.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0366  transposase  92.68 
 
 		 888 bp  58  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0096  transposase  92.68 
 
 		 888 bp  58  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0717  transposase  92.68 
 
 		 708 bp  58  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1453  transposase  92.68 
 
 		 888 bp  58  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1536  transposase  92.68 
 
 		 888 bp  58  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2584  transposase  92.68 
 
 		 888 bp  58  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2744  transposase  92.68 
 
 		 888 bp  58  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936564  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6582  transposase  84.42 
 
 		 675 bp  58  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  100 
 
 		 1416 bp  52  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  100 
 
 		 840 bp  52  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0460  ISRSO10-transposase ORFB protein  88 
 
 		 603 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2331  ISRSO10-transposase ORFB protein  88 
 
 		 888 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1830  ISRSO10-transposase ORFB protein  88 
 
 		 849 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.189696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1435  ISRSO10-transposase ORFB protein  88 
 
 		 603 bp  52  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927886  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  100 
 
 		 1197 bp  52  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1120  IS1 transposase  100 
 
 		 351 bp  52  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0305  IS2 ORF2  96.55 
 
 		 366 bp  50.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.726733 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0027    89.74 
 
 		 120 bp  46.1  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>