More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3118 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3118  IS2 transposase orfB  100 
 
 		 147 aa  312  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301889 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0076  IS2, transposase orfB  92.93 
 
 		 303 aa  193  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0042  IS2, transposase orfB  92.93 
 
 		 303 aa  193  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3631  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 206 aa  193  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3225  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1321  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1246  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0408057  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0110  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.103297  hitchhiker  0.00326457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0399  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1088  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1205  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.83389  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1668  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1888  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494374 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2613  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2131  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01904  IS2 insertion element transposase InsAB'  92.93 
 
 		 218 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2946  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4301  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3993  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4589  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4144  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3274  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0655  Integrase catalytic region  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0830  Integrase catalytic region  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1661  Integrase catalytic region  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2065  Integrase catalytic region  92.93 
 
 		 218 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0456907  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2243  Integrase catalytic region  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.578947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3245  Integrase catalytic region  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3725  Integrase catalytic region  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0073  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629539  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0011  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0002  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0237  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.940126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3900  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1767  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1732  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1670  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1567  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1906  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1121  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0990  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4027  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0034  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0013  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4646  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0249  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4872  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2145  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2596  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2959  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0394  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4760  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0704  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0859  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0290  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0920  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0119878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3732  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0901  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3165  IS2 transposase orfB  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1950  insertion element IS2 transposase InsD  92.93 
 
 		 301 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0086  IS2, transposase orfB, truncation  91.92 
 
 		 223 aa  192  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0106176  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1561  insertion element IS2 transposase InsD  91.92 
 
 		 301 aa  191  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1920  IS2 ORF2  93.18 
 
 		 88 aa  172  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4353  insertion sequence 2 OrfB protein  95.38 
 
 		 65 aa  133  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1900  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2922  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129263  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4913  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00024  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00213822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00211  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00534  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00216  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00504  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00545  IS1 protein insB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.160638  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00025  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00509  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.584705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01244  IS1 protein InsA  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01373  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01881  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000653204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04179  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02143  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02270  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02514  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03227  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04286  IS1 protein InsB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.448136  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0739  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00024765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0780  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1140  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0049533  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1386  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1530  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1651  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000315416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1779  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2416  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0295227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2650  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0337075  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2785  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000643973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3007  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000875521  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3091  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3145  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3240  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.035564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3688  IS1, transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0086  IS1 transposase orfB  100 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0718475  hitchhiker  0.0000000542412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>