More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3051 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3051  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
526 aa  1024    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252815  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1878  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  49.12 
 
 
883 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.759992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1707  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  47.65 
 
 
849 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3247  Osmosensitive K channel His kinase sensor  41.8 
 
 
853 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0599  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
938 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
851 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1437  Osmosensitive K channel His kinase sensor  37.04 
 
 
854 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.429266  normal  0.268919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6794  Osmosensitive K channel His kinase sensor  38.92 
 
 
891 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431431  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4089  Osmosensitive K channel His kinase sensor  36.71 
 
 
845 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3779  Osmosensitive K channel His kinase sensor  38.18 
 
 
857 aa  247  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135978  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3803  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
846 aa  246  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109811  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1955  Osmosensitive K channel His kinase sensor  38.06 
 
 
902 aa  244  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0300  Osmosensitive K channel His kinase sensor  37.27 
 
 
850 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
850 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1195  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
609 aa  239  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3228  Osmosensitive K channel His kinase sensor  40.83 
 
 
854 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27030  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 
853 aa  233  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.553859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11046  two component system sensor histidine kinase kdpD  36.78 
 
 
860 aa  231  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1019  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 
858 aa  227  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0833425  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3283  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
854 aa  219  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331513  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1632  Osmosensitive K channel His kinase sensor  40.69 
 
 
844 aa  213  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1513  Osmosensitive K channel His kinase sensor  36.56 
 
 
832 aa  210  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.919123  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
836 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
836 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4607  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
836 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  28.86 
 
 
910 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
902 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
912 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
888 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
905 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  29.96 
 
 
907 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
901 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  31.51 
 
 
539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3552  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
402 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  30.72 
 
 
902 aa  164  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5030  Osmosensitive K channel His kinase sensor  37.97 
 
 
815 aa  163  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
902 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
905 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  31.46 
 
 
885 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
907 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  28.05 
 
 
905 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  29.82 
 
 
902 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  32.99 
 
 
905 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
897 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
892 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
889 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
897 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
900 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2020  histidine kinase  39.62 
 
 
399 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376076  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
895 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
890 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1864  ATPase domain-containing protein  41.06 
 
 
371 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
907 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
887 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
887 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  34.38 
 
 
356 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
894 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2066  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000687281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0250  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
541 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
907 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  29.5 
 
 
894 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  29.5 
 
 
894 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
897 aa  134  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  29.5 
 
 
894 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  30.61 
 
 
937 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  29.13 
 
 
512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  27.7 
 
 
895 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  29.31 
 
 
894 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4625  histidine kinase  26.9 
 
 
505 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  28.33 
 
 
894 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  28.9 
 
 
895 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  28.9 
 
 
894 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
894 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  28.11 
 
 
915 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  28.9 
 
 
894 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  28.9 
 
 
894 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  28.9 
 
 
894 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  28.9 
 
 
894 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0713  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
867 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  28.93 
 
 
905 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  27.27 
 
 
909 aa  127  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3493  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
867 aa  127  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.789076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
522 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  30.35 
 
 
895 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  27.1 
 
 
897 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  28.84 
 
 
895 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
894 aa  123  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
530 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  28.65 
 
 
908 aa  123  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1465  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 
895 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.113581  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0387  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  27.6 
 
 
908 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  28.19 
 
 
908 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  26.81 
 
 
910 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
902 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.699413  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1396  two-component system, sensor kinase protein KdpD  28.16 
 
 
993 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1245  sensor histidine kinase KdpD  28.16 
 
 
993 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.561584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>