More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1955 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1019  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  51.59 
 
 		 858 aa  717    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0833425  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1955  Osmosensitive K channel His kinase sensor  100 
 
 		 902 aa  1745    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3247  Osmosensitive K channel His kinase sensor  47.21 
 
 		 853 aa  657    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27030  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  50.06 
 
 		 853 aa  668    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.553859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4089  Osmosensitive K channel His kinase sensor  49.01 
 
 		 845 aa  699    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5030  Osmosensitive K channel His kinase sensor  53.65 
 
 		 815 aa  639    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1632  Osmosensitive K channel His kinase sensor  51.89 
 
 		 844 aa  675    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3283  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  52.33 
 
 		 854 aa  695    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331513  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3779  Osmosensitive K channel His kinase sensor  49.5 
 
 		 857 aa  693    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0599  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  50.92 
 
 		 938 aa  748    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6794  Osmosensitive K channel His kinase sensor  48.88 
 
 		 891 aa  718    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431431  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  53.26 
 
 		 836 aa  756    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1437  Osmosensitive K channel His kinase sensor  52.05 
 
 		 854 aa  773    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.429266  normal  0.268919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11046  two component system sensor histidine kinase kdpD  51.43 
 
 		 860 aa  771    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3803  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  51.02 
 
 		 846 aa  731    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109811  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  52.41 
 
 		 851 aa  755    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  53.26 
 
 		 836 aa  756    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  51.87 
 
 		 850 aa  763    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0300  Osmosensitive K channel His kinase sensor  50.8 
 
 		 850 aa  673    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3228  Osmosensitive K channel His kinase sensor  73.41 
 
 		 854 aa  1100    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4607  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  53.37 
 
 		 836 aa  755    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1513  Osmosensitive K channel His kinase sensor  47.69 
 
 		 832 aa  628  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.919123  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1878  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 883 aa  625  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.759992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1707  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.87 
 
 		 849 aa  582  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  34.75 
 
 		 910 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 905 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  35.48 
 
 		 885 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 888 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 895 aa  432  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 892 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 897 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  34.71 
 
 		 905 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 890 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  35.65 
 
 		 905 aa  416  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 907 aa  416  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 905 aa  412  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 889 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 912 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 902 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 907 aa  406  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  33.63 
 
 		 895 aa  401  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 901 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  35.19 
 
 		 937 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  33.92 
 
 		 895 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  32.37 
 
 		 908 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1024  two-component system, sensor kinase protein KdpD  33.59 
 
 		 1035 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3249  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 944 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  34.39 
 
 		 907 aa  396  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1311  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 944 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.162113 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  32.74 
 
 		 902 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  33.84 
 
 		 894 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  33.95 
 
 		 894 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 887 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 897 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  33.84 
 
 		 894 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 894 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  32.69 
 
 		 908 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  32.26 
 
 		 908 aa  392  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 887 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  33.84 
 
 		 894 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  33.66 
 
 		 905 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 897 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  34.07 
 
 		 895 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 894 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1396  two-component system, sensor kinase protein KdpD  33.77 
 
 		 993 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4648  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 900 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1673  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.3 
 
 		 947 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2285  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.3 
 
 		 947 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1245  sensor histidine kinase KdpD  33.77 
 
 		 993 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.561584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1253  sensor histidine kinase KdpD  33.77 
 
 		 993 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  33.96 
 
 		 894 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2308  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 947 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5612  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 947 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  33.96 
 
 		 894 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  34.07 
 
 		 894 aa  382  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  33.7 
 
 		 897 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 896 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 949 aa  379  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  34 
 
 		 894 aa  379  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2201  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 945 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2323  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 945 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  33.96 
 
 		 894 aa  379  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  34.03 
 
 		 895 aa  379  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0993  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 951 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  33.63 
 
 		 894 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5921  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 904 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 894 aa  372  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  32.36 
 
 		 909 aa  372  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1465  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 895 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.113581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  31.92 
 
 		 915 aa  369  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3730  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.37 
 
 		 884 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4158  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 884 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1710  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 884 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 902 aa  363  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  32.4 
 
 		 910 aa  360  6e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3716  sensor protein KdpD  33.95 
 
 		 914 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2245  sensor protein KdpD  32.89 
 
 		 887 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1087  sensor protein KdpD  33.26 
 
 		 954 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0780  sensor histidine kinase KdpD  33.26 
 
 		 954 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.795165  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  33.91 
 
 		 906 aa  351  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>